More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3703 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  78.77 
 
 		 212 aa  356  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  78.77 
 
 		 212 aa  356  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  73.11 
 
 		 211 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  69.34 
 
 		 212 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  69.34 
 
 		 213 aa  302  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  69.34 
 
 		 211 aa  301  7.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  63.27 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  63.98 
 
 		 218 aa  285  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  63.51 
 
 		 218 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  63.51 
 
 		 218 aa  281  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  63.03 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  61.32 
 
 		 217 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  61.32 
 
 		 217 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  61.32 
 
 		 217 aa  277  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  63.03 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  62.56 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  55.1 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 209 aa  221  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  56.37 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36377  Plastid ribosomal protein L3, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  54.03 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  52.2 
 
 		 222 aa  214  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  53.57 
 
 		 209 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  53.57 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  54.69 
 
 		 212 aa  214  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 216 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  49.76 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 211 aa  204  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1418  ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 259 aa  203  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.710723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  50 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  47.32 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  48.29 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.6 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 217 aa  197  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  48.19 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  51.02 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  51.18 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>