More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1650 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  94.93 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  94.93 
 
 		 217 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  88.94 
 
 		 217 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  75.94 
 
 		 219 aa  339  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  74.42 
 
 		 218 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 218 aa  331  6e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  73.81 
 
 		 218 aa  330  8e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  73.11 
 
 		 218 aa  328  4e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  73.58 
 
 		 218 aa  328  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  62.74 
 
 		 213 aa  291  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  61.32 
 
 		 212 aa  277  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  59.24 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  58.49 
 
 		 212 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  58.49 
 
 		 212 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  58.77 
 
 		 211 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  56.39 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  55.19 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  52.31 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 210 aa  217  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36377  Plastid ribosomal protein L3, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  49.52 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  50 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  46.5 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  47.52 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  204  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 211 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  48.51 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  47.44 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  46.15 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  46.76 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  46.04 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  46.26 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0391  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000698132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  51 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  51 
 
 		 207 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  44.61 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  45.59 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 226 aa  193  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  46.04 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  45.6 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0338  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274222  decreased coverage  0.000311926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  44.33 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0273  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000366458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0278  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000211938  decreased coverage  0.00000000129288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  44.34 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  41.67 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  44.88 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  43.14 
 
 		 206 aa  191  8e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1264  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00436289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>