More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1418 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1418  ribosomal protein L3  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.710723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 212 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 217 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 213 aa  195  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  48.54 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 212 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  48.06 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.23 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 221 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 217 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 210 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  43.28 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  41.79 
 
 		 218 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 209 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  44.08 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  43.78 
 
 		 217 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  43.69 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 217 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  40.09 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  48.24 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  41.29 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  41.79 
 
 		 218 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  45.02 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 209 aa  178  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  44.02 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 209 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  43.27 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  44.81 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  41.2 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 215 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  43.2 
 
 		 219 aa  172  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  40.8 
 
 		 219 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  42.31 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  41.59 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  42.31 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 209 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  45 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  43.35 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  42.38 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  44.86 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 207 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  41.67 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 212 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  43.58 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  41.15 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  41.35 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  43.56 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  41.83 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  41.35 
 
 		 205 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  40.78 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  42.29 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 210 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  43.46 
 
 		 227 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>