More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1046 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1046  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 311 aa  626  1e-178  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.326477  normal  0.81687 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0930  aminotransferase class I and II  66.34 
 
 		 312 aa  401  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102641 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0016  aminotransferase, class I and II  64.82 
 
 		 312 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1801  aminotransferase class I and II  39.81 
 
 		 337 aa  223  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000372137  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 382 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  25.71 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  25.65 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  26.25 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  24.04 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0914  L-aspartate aminotransferase  25.61 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  24.31 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2040  aminotransferase, class I and II  24.82 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  23.53 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1791  aminotransferase, class I and II  25.18 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0810  aminotransferase class I and II  26.57 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  24.69 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  23.31 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  22.6 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  28.09 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0290  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.626117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  26.89 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  22.65 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.56 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  29.01 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  24.92 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1417  aminotransferase, class I and II  27.12 
 
 		 406 aa  62.4  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  26.48 
 
 		 396 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  22.19 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.37 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  23.53 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  23.1 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  22.98 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1536  aminotransferase  35.53 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0541344 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  24.91 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  22.95 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  30.91 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  28.82 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  24.26 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  23.76 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  27.17 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  26.91 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.24 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  22.76 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  24.57 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.86 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2118  valine--pyruvate transaminase  25.34 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.36 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  24.24 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2500  valine--pyruvate transaminase  22.4 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1369  aminotransferase, class I and II  32.67 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.481739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  27.36 
 
 		 406 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  28.49 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  24.64 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  25 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  27.59 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 478 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  23.47 
 
 		 456 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  26.1 
 
 		 353 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  25.61 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  24.46 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  23.88 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  22.8 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1160  aminotransferase  23.8 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  29.71 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  24.75 
 
 		 492 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  28.95 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  24.55 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  26.28 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0062  valine--pyruvate transaminase  22.47 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  26.7 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.32 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2946  histidinol-phosphate aminotransferase  23.2 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0055  valine--pyruvate transaminase  22.47 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 477 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  29.29 
 
 		 421 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0035  valine--pyruvate transaminase  23.08 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  24.63 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  21.25 
 
 		 375 aa  53.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  24.07 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  29.35 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  24.49 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2440  valine--pyruvate transaminase  23.64 
 
 		 444 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.84 
 
 		 498 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  27.65 
 
 		 413 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  23.56 
 
 		 461 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  23.19 
 
 		 395 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  23.79 
 
 		 477 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.57 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  24.22 
 
 		 401 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  23.88 
 
 		 393 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.39 
 
 		 488 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  30.37 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  27.49 
 
 		 399 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0770  aminotransferase, class I and II  23.68 
 
 		 397 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0102863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>