More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0016 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0016  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0930  aminotransferase class I and II  95.83 
 
 		 312 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102641 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1046  aminotransferase, class I and II  64.82 
 
 		 311 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.326477  normal  0.81687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1801  aminotransferase class I and II  39.75 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000372137  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  26.91 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2040  aminotransferase, class I and II  26.64 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0810  aminotransferase class I and II  28.47 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  29.45 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  25.95 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0914  L-aspartate aminotransferase  28.97 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1453  transaminase  25.44 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  26.62 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  29.12 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1791  aminotransferase, class I and II  27.15 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  24.07 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  26.85 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  24.35 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  24.22 
 
 		 372 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  28.17 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  22.48 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  25.34 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  26.16 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  27.53 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2514  aminotransferase  26.85 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  23.7 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  25.19 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1536  aminotransferase  39.42 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0541344 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  26.39 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0543  aminotransferase, class I and II  25.25 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0251  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  29.82 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1540  aminotransferase class I and II  30.34 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  25.18 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  30.36 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  28.82 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1417  aminotransferase, class I and II  32.54 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  23.05 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2149  putative histidinol-phosphate aminotransferase  24.47 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000106616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  23.66 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.95 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  25.89 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  30.3 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0290  aminotransferase class I and II  34.19 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.626117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  26.55 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2013  putative histidinol-phosphate aminotransferase HisC  24.47 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160507  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  25.37 
 
 		 409 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9152  aspartate aminotransferase  37.23 
 
 		 409 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  24.43 
 
 		 408 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 492 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  25 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  25.99 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  25.56 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1993  histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase  24.11 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  25.18 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.5 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1411  aminotransferase class I and II  25.74 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1734  aminotransferase class I and II  28.09 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  29.28 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  25.56 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  29.65 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1160  aminotransferase  28.65 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366108 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  26.28 
 
 		 385 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1904  aminotransferase, class I and II  24.6 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  26.84 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.08 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  27.91 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  25.67 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  25.7 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  25.63 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.6 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  27.94 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  27.55 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.87 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  27.14 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  25 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0536  L-aspartate aminotransferase  25.08 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  30.41 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  31.37 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  27.75 
 
 		 397 aa  54.3  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  27.03 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  26.34 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  26.99 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.37 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.95 
 
 		 498 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1760  aminotransferase class I and II  24.77 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  29.23 
 
 		 403 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  29.14 
 
 		 400 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  27.55 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  24.75 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0727  aminotransferase class I and II  27.2 
 
 		 382 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.906786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  25 
 
 		 417 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  23.51 
 
 		 398 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  25.18 
 
 		 376 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 		 367 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>