More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2696 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 395 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  44.74 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  43.64 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  42.38 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  46.39 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  44.68 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  44.06 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  42.25 
 
 		 375 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  41.51 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 		 392 aa  288  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  41.41 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  41.15 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  38.99 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  40.41 
 
 		 385 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  34.25 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  34 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  34.95 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  36.07 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  36.84 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  36.99 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  38.85 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  37.06 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 383 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  37.56 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  32.28 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 		 398 aa  242  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  32.28 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  32.28 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  32.38 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  32.02 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  32.02 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  36.06 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  32.02 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.57 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  37.8 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  37.8 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  35.26 
 
 		 521 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  31.76 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  31.59 
 
 		 383 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  35.2 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  34.18 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  33.33 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  35.28 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 392 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  36.95 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  34.01 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  37.37 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  33 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  32.23 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  35.22 
 
 		 514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  36.9 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  32.73 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  36.76 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  34.18 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  34.18 
 
 		 390 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  34.18 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  34.18 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  34.97 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  33.93 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  33.93 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  36.5 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  32.65 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  33.92 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  33.67 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  30.52 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  34.36 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  31.47 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 		 390 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  32.2 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  34.11 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  31.12 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  33.16 
 
 		 372 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  31.78 
 
 		 417 aa  203  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  34.19 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  35.45 
 
 		 414 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  33.42 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>