More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1536 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1536  aminotransferase  100 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0541344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0290  aminotransferase class I and II  60.46 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.626117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1369  aminotransferase, class I and II  61.18 
 
 		 308 aa  338  9e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.481739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.46 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.17 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  26.76 
 
 		 364 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  25.5 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1426  aminotransferase class I and II  29.86 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  25.5 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2182  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.09 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.243931  hitchhiker  0.000290112 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  27.71 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.48 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.29 
 
 		 361 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  28.14 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  25.14 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  26.35 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  26.35 
 
 		 364 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  24.46 
 
 		 365 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.68 
 
 		 399 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  26.35 
 
 		 364 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  24.62 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  29.28 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  23.89 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  26.35 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.97 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  26.05 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.52 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  28.28 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.33 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  27.71 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.03 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.48 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.28 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  30.54 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.11 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.6 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  29.64 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  30 
 
 		 863 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  24.47 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.28 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.49 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.6 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1371  putative aminotransferase  28.11 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.03 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  26.35 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  24.18 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  26.3 
 
 		 363 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  28.41 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  27.71 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  23.22 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.4 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  24.72 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  27.58 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  25.91 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  26.15 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  25.75 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 807 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.17 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  32.92 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  36.67 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  26.78 
 
 		 630 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  29.64 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  30.51 
 
 		 863 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.86 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  27.71 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  27.35 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  26.85 
 
 		 852 aa  69.7  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.34 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  23.55 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.86 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.97 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0016  aminotransferase, class I and II  39.42 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0382489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  33.66 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  26.55 
 
 		 858 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.16 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  26.02 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  29.11 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  34.67 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0930  aminotransferase class I and II  39.81 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  31.98 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  23.56 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  22.65 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1046  aminotransferase, class I and II  35.53 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.326477  normal  0.81687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.79 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  34 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  25.97 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  34.75 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  26.67 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  34 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  34.44 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  23.31 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.44 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  33.77 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>