More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1447 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 
332 aa  669    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  52.31 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  53.17 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  47.13 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  48.48 
 
 
334 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  37.95 
 
 
498 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  37.26 
 
 
496 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.82 
 
 
368 aa  185  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.08 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  33.91 
 
 
368 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.06 
 
 
498 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  34.46 
 
 
357 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.62 
 
 
361 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.75 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.75 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
364 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  31.79 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.8 
 
 
375 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.46 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.98 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.02 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.77 
 
 
357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  32.5 
 
 
363 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.66 
 
 
358 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.09 
 
 
370 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.99 
 
 
379 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  32.79 
 
 
362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.77 
 
 
362 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  31.37 
 
 
354 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  31.37 
 
 
354 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  29.45 
 
 
372 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.51 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 
351 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  32.56 
 
 
346 aa  145  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 
356 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  31.96 
 
 
863 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  33.73 
 
 
864 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
370 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  30.43 
 
 
386 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 
380 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.88 
 
 
352 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  30.63 
 
 
362 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.48 
 
 
352 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  32.16 
 
 
863 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  32.37 
 
 
360 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 
362 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 
371 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  33.72 
 
 
361 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  34.1 
 
 
852 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0067  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
351 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.23686  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
380 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
370 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  28.69 
 
 
358 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.64 
 
 
352 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  30.43 
 
 
366 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.46 
 
 
364 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
370 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  31.22 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  26.84 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  31.48 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  28.13 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  31.83 
 
 
357 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  32.39 
 
 
364 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  26.84 
 
 
370 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  26.84 
 
 
370 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.05 
 
 
361 aa  133  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  26.84 
 
 
370 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.02 
 
 
357 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  26.57 
 
 
370 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  31.27 
 
 
374 aa  132  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  28.27 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  28.04 
 
 
375 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  28.4 
 
 
365 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  26.55 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.48 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.28 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  31.53 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.52 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  30.14 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  26.55 
 
 
370 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  31.53 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.47 
 
 
359 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 
360 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.91 
 
 
356 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 
365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 
364 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 
365 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
362 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  26.25 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  28.78 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 
355 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>