More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0869 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 
358 aa  732    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  53.91 
 
 
399 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  52.96 
 
 
379 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  52.11 
 
 
357 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  52.23 
 
 
370 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  51.15 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  40.17 
 
 
354 aa  279  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  40.17 
 
 
354 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.85 
 
 
366 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  41.64 
 
 
364 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  41.36 
 
 
364 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  40.9 
 
 
364 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  40.9 
 
 
364 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
364 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.28 
 
 
360 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.07 
 
 
362 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.54 
 
 
362 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  37.18 
 
 
375 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.6 
 
 
864 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  36.69 
 
 
356 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  37.5 
 
 
863 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  38.46 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.28 
 
 
351 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  32.78 
 
 
358 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  32.78 
 
 
358 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  36.72 
 
 
852 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  37.46 
 
 
863 aa  215  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.27 
 
 
352 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  38.06 
 
 
357 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  39.78 
 
 
367 aa  202  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.87 
 
 
364 aa  202  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  29.53 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  29.25 
 
 
371 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.8 
 
 
361 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  28.69 
 
 
371 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  36.29 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  32.79 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 
371 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  27.58 
 
 
371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.52 
 
 
361 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.3 
 
 
362 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.1 
 
 
362 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.43 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  35.13 
 
 
350 aa  182  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  33.78 
 
 
378 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 
339 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  33.52 
 
 
368 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  33.52 
 
 
368 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.14 
 
 
368 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  37.95 
 
 
366 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
368 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  29.69 
 
 
359 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.39 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.65 
 
 
496 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  35.1 
 
 
858 aa  172  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  32.14 
 
 
360 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.18 
 
 
498 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 
355 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.87 
 
 
366 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31 
 
 
498 aa  169  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.53 
 
 
359 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 
399 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.19 
 
 
356 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  32.45 
 
 
383 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.17 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  33.61 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  29.11 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 
357 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.28 
 
 
352 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  30.62 
 
 
360 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
362 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.36 
 
 
360 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 
364 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2525  histidinol-phosphate aminotransferase  30.32 
 
 
358 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.017315  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.55 
 
 
360 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  36.25 
 
 
366 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.7 
 
 
348 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  32.03 
 
 
334 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.43 
 
 
366 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.66 
 
 
332 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 
352 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.48 
 
 
372 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 
386 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.25 
 
 
372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.91 
 
 
342 aa  152  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
386 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
360 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  29.83 
 
 
358 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.55 
 
 
374 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
352 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  31.02 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.74 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  27.15 
 
 
374 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1401  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.9 
 
 
377 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  31.2 
 
 
331 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.97 
 
 
374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 
374 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>