More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_593 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  95.38 
 
 		 368 aa  721    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  95.38 
 
 		 368 aa  721    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 368 aa  752    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  90.76 
 
 		 368 aa  690    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  40.43 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  37.85 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.62 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  37.07 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.49 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.51 
 
 		 375 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  37.43 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.46 
 
 		 498 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  35.48 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.85 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.72 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.72 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  34.92 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  32.28 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  34.84 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.91 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  36.08 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  34.2 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.44 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.62 
 
 		 496 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 		 358 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 		 362 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  34.49 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  30.9 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 		 498 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  32.59 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  35.16 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  35.04 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.47 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  32.24 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  31.62 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  31.64 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  32.2 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  32.24 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.64 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.14 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  32.75 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.83 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.23 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.07 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 		 363 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  31.28 
 
 		 863 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  31.89 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  29.17 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  28.69 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  28.69 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  33.01 
 
 		 364 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  31.73 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.55 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 		 374 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 		 370 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  32.3 
 
 		 374 aa  156  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 364 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  33 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  31.11 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.2 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.41 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  33.22 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.64 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  31.22 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 		 373 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>