More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1623 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  100 
 
 		 358 aa  706    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  98.6 
 
 		 358 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  40.34 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.34 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  37.47 
 
 		 354 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  36.21 
 
 		 354 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.64 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.87 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.03 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.78 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.74 
 
 		 379 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.09 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 		 375 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  27.53 
 
 		 364 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.19 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  26.97 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  27.25 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  27.25 
 
 		 364 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  27.25 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.81 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  34.36 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.01 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  29.88 
 
 		 863 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.3 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  31.67 
 
 		 864 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  29.13 
 
 		 852 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.3 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  32.09 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  29.8 
 
 		 863 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.13 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  30.81 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  30.34 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 		 368 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  29.11 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  27.12 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  34.49 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  29.68 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  32.5 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  29.12 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  31.94 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  31.94 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  27.5 
 
 		 367 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  29.01 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  28.12 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  28.14 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.73 
 
 		 364 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.62 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  28.77 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  24.55 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.5 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  28.08 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2203  histidinol-phosphate aminotransferase  28.25 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.1 
 
 		 498 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.69 
 
 		 496 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  26.05 
 
 		 371 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  27.48 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  28.45 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.76 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  28.44 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  30.34 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.43 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.87 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.23 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  30.58 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  29.23 
 
 		 357 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  30.49 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  26.48 
 
 		 858 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.87 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  29.43 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  28.49 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  29.12 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  26.5 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  29.38 
 
 		 373 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  25.81 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  28.14 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  26.26 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.4 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  26.27 
 
 		 370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  27.67 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.45 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.13 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  27.54 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  24.67 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  30.37 
 
 		 358 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  28.94 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  27.56 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  26.55 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  27.09 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  26.22 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>