More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0633 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 354 aa  711    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  71.71 
 
 		 357 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  60.5 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  43.98 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  37.85 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  37.57 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  38.42 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  38.42 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  45.63 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.81 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  35.77 
 
 		 852 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.29 
 
 		 399 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  34.1 
 
 		 864 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.36 
 
 		 357 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.07 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  32.17 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.93 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  31.21 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 358 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.93 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  33.93 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  29.53 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.16 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.24 
 
 		 370 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 		 374 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.44 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  29.5 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.34 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  33.98 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 		 374 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.12 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  27.62 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  29 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  27.33 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  30.97 
 
 		 356 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  27.62 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  34.29 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.64 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  27.91 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  28.28 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  33.43 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  27.25 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.27 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.72 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  27.99 
 
 		 354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.5 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  27.25 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  28.02 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  30.27 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 		 370 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  31.74 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  35.17 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  31.13 
 
 		 863 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  31.67 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.08 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.58 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  28.45 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  32.68 
 
 		 364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  29.77 
 
 		 399 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  26.67 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  32.55 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  30.42 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  32.12 
 
 		 364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  32.4 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  31.41 
 
 		 863 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  31.25 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  30.81 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 		 370 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  32.12 
 
 		 364 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  26.65 
 
 		 358 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>