More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0747 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  100 
 
 
364 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  98.08 
 
 
364 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  98.63 
 
 
364 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  98.35 
 
 
364 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  98.08 
 
 
364 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  36.06 
 
 
354 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  35.77 
 
 
354 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
358 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.42 
 
 
357 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
399 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.29 
 
 
379 aa  242  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.47 
 
 
370 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  33.8 
 
 
364 aa  238  8e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  35.22 
 
 
356 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.76 
 
 
362 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  40.46 
 
 
361 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.87 
 
 
375 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.17 
 
 
362 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  40.23 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.79 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.06 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  37.87 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 
362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  36.16 
 
 
366 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  37.43 
 
 
864 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.72 
 
 
360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
351 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
352 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  38.25 
 
 
852 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.27 
 
 
362 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.69 
 
 
362 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  38.79 
 
 
350 aa  203  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  27.25 
 
 
358 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  27.25 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.53 
 
 
361 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  35.49 
 
 
863 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  35.54 
 
 
367 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  35 
 
 
863 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  36.5 
 
 
346 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  30.68 
 
 
359 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  32.53 
 
 
378 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.71 
 
 
359 aa  169  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.02 
 
 
361 aa  169  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.62 
 
 
360 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.57 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.85 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  29.35 
 
 
360 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.2 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  34.52 
 
 
340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.56 
 
 
498 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.73 
 
 
496 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  31.38 
 
 
360 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.88 
 
 
357 aa  157  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  32.15 
 
 
858 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.42 
 
 
360 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  29.43 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 
363 aa  153  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.91 
 
 
342 aa  152  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.39 
 
 
364 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 
342 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.03 
 
 
498 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
370 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
370 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.79 
 
 
348 aa  149  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  26.39 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  27.17 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.14 
 
 
372 aa  147  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  32.25 
 
 
352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.95 
 
 
368 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.06 
 
 
368 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.06 
 
 
368 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  31.12 
 
 
383 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  29.1 
 
 
371 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 
339 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.72 
 
 
374 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  26.33 
 
 
371 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  30.57 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.05 
 
 
357 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  26.89 
 
 
371 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 
360 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  27.01 
 
 
373 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  29.53 
 
 
357 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  26.76 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  32.24 
 
 
335 aa  136  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  31.77 
 
 
383 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  30.75 
 
 
334 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
807 aa  137  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  26.63 
 
 
370 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  26.63 
 
 
370 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  26.63 
 
 
370 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  30.9 
 
 
374 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  26.63 
 
 
370 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  26.35 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1401  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  26.35 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 
373 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.05 
 
 
352 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  26.63 
 
 
370 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
848 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>