More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1401 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1401  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 
377 aa  787    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1935  aminotransferase, class I and II  39.12 
 
 
390 aa  272  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3015  aminotransferase class I and II  38.66 
 
 
423 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.52 
 
 
399 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.2 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.9 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.55 
 
 
370 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  26.95 
 
 
354 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  27.49 
 
 
354 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  27.98 
 
 
364 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  29.68 
 
 
364 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  29.89 
 
 
852 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.15 
 
 
362 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  29.68 
 
 
364 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.11 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.99 
 
 
375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 
364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.97 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  26.82 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  28.53 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  28.53 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.54 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.07 
 
 
361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  25.9 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  27.84 
 
 
368 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  25.36 
 
 
358 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  26.21 
 
 
358 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.43 
 
 
362 aa  123  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  28.61 
 
 
864 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  25.34 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.47 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  28.45 
 
 
357 aa  113  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.92 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.25 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.58 
 
 
498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 
383 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  26.42 
 
 
863 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  26.09 
 
 
863 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.54 
 
 
356 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.47 
 
 
352 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  31.61 
 
 
357 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  27.69 
 
 
366 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.17 
 
 
364 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.61 
 
 
351 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.69 
 
 
359 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  27.35 
 
 
371 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  26.28 
 
 
342 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.58 
 
 
498 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.06 
 
 
496 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.07 
 
 
364 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.42 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  26 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.51 
 
 
372 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  27.33 
 
 
357 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.88 
 
 
348 aa  96.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  26.2 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  28.75 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  30.56 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 
351 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  26.8 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.91 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  27.83 
 
 
346 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  24.79 
 
 
361 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  25.95 
 
 
365 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  28.23 
 
 
367 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  27.73 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 
365 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.81 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  26.37 
 
 
331 aa  92  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  27.92 
 
 
346 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  25.43 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  25.99 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  23.36 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.69 
 
 
360 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.7 
 
 
807 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2372  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.88 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  0.167538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.53 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  26.85 
 
 
350 aa  87  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  26.11 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  21.56 
 
 
364 aa  86.3  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  23.4 
 
 
356 aa  86.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  25.88 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  23.57 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.74 
 
 
848 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  24.25 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  21.14 
 
 
366 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.14 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  27.35 
 
 
858 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.38 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  26.9 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  21.41 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  27.58 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.88 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.67 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  25.35 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  25.63 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>