More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0650 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 366 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  40.16 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  40.16 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  39.62 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.66 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  46.22 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  41.27 
 
 		 357 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  39.2 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.22 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  40.17 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 		 357 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.95 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  42.7 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  37.06 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 		 362 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.67 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.91 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  34.6 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  38.11 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.33 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.71 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 		 358 aa  176  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  31.64 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  36.41 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  35.11 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.34 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.87 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  35.96 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.81 
 
 		 360 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  29.94 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  33.24 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  34.79 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  28.94 
 
 		 371 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  27.79 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 365 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.55 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  35.14 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  31.86 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  35.62 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  33.82 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  35.43 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.19 
 
 		 498 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  27.3 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  38.86 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.87 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  31.11 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  36.25 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  34.8 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  35.21 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  31.81 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 		 385 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  31.81 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  31.04 
 
 		 371 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  35.29 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.44 
 
 		 364 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.8 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  34.94 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>