More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2372 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2372  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 379 aa  788    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal  0.167538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0787  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.37 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.226341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.63 
 
 		 496 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 		 498 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  26.11 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  25.28 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.37 
 
 		 498 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  29.05 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.98 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  28.72 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.11 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  29.19 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.57 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  22.22 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  28.38 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.81 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  25.37 
 
 		 630 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  29.05 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.55 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.62 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.39 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  23.22 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  26.12 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.01 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.74 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  23.69 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  23.72 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.84 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.84 
 
 		 368 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  25.75 
 
 		 863 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.95 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  24.43 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.38 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.07 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.53 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  24.57 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  27.96 
 
 		 359 aa  106  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  26.6 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  26.76 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  24.85 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  25.66 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  26.98 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  24.29 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  25.46 
 
 		 858 aa  103  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  26.59 
 
 		 864 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  26.09 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  27.93 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.46 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  27.41 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  25.96 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.69 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  25.14 
 
 		 863 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  27.43 
 
 		 852 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  26.11 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  27.54 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.08 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  26.46 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.14 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  26.78 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  27.21 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.53 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  25.3 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  26.56 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  25.29 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.07 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  27.24 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.01 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  24.67 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  28.08 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  27.14 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1426  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  24.48 
 
 		 360 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  26.92 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  26.03 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  27.4 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  24.84 
 
 		 342 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.65 
 
 		 362 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  24.11 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  23.94 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  22.52 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  26.4 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  25.96 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  23.53 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  25.63 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  31.13 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.83 
 
 		 357 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.32 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  25.85 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1401  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.88 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>