More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0082 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  100 
 
 
390 aa  810    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  40.86 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  40.85 
 
 
379 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  39.33 
 
 
390 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 
367 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
393 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  38.55 
 
 
391 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.72 
 
 
386 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  36.53 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 
370 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 
370 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  35.63 
 
 
370 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  34.66 
 
 
363 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  32.35 
 
 
374 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.63 
 
 
370 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
370 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  33.23 
 
 
372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  34.04 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
362 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  34.11 
 
 
383 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 
370 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  33.73 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 
358 aa  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
386 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 
370 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  32.83 
 
 
342 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  30.3 
 
 
411 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  33.95 
 
 
351 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
371 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.99 
 
 
392 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  35.63 
 
 
370 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
352 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
365 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
365 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  28.76 
 
 
374 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 
389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
374 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
374 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  33.76 
 
 
363 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  31.89 
 
 
372 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.14 
 
 
369 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.82 
 
 
373 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
355 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 
383 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
369 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  30.89 
 
 
353 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  30.89 
 
 
353 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  30.89 
 
 
353 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  33.02 
 
 
353 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 
369 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  28.39 
 
 
387 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  27.58 
 
 
367 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.62 
 
 
370 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
362 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  33.76 
 
 
365 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
360 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  29.54 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  32.4 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 
374 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  30.93 
 
 
366 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  31.29 
 
 
353 aa  155  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  32.33 
 
 
358 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  32.33 
 
 
358 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  32.33 
 
 
358 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 
352 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
362 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 
352 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  30.27 
 
 
350 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  34.74 
 
 
369 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  26.81 
 
 
371 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
375 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  31.79 
 
 
391 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  29.45 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  31.72 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 
365 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
362 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  153  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 
362 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  31.6 
 
 
351 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
374 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  30.22 
 
 
359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  26.81 
 
 
371 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  32.55 
 
 
374 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 
373 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 
363 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 
365 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  34.75 
 
 
360 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>