More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4751 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  100 
 
 
383 aa  791    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  75.46 
 
 
411 aa  591  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  40.99 
 
 
350 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  39.27 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 
394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  36.17 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.17 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
363 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
370 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
362 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
388 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 
383 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  33.02 
 
 
362 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  30.82 
 
 
395 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  28.9 
 
 
390 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 
370 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 
379 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
365 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
365 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
370 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 
374 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  26.26 
 
 
367 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.33 
 
 
362 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 
365 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  32.57 
 
 
365 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 
362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
374 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
376 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  29.03 
 
 
374 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
374 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
374 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
371 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
365 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  29.66 
 
 
391 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
369 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  30.33 
 
 
359 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 
367 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  32.44 
 
 
348 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
386 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
370 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
373 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  28.95 
 
 
373 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  31.27 
 
 
391 aa  149  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 
362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  31.4 
 
 
374 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  30.92 
 
 
375 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 
364 aa  146  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.56 
 
 
367 aa  146  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
363 aa  146  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 
374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
370 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  30.65 
 
 
348 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
370 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 
348 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 
389 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
365 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
377 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
369 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
350 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  29.85 
 
 
366 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  29.74 
 
 
377 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
350 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  31 
 
 
351 aa  144  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
366 aa  143  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  27.44 
 
 
390 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.04 
 
 
369 aa  143  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 
379 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 
370 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  28.04 
 
 
357 aa  143  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
370 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  28.72 
 
 
393 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  30.36 
 
 
348 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  31.9 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  28.53 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  30.21 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  26.81 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
366 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  29.47 
 
 
366 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  28.48 
 
 
362 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  30.96 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  31.38 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>