More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3478 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  100 
 
 
379 aa  784    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  40.85 
 
 
390 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
390 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  35.84 
 
 
395 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  36.87 
 
 
391 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 
367 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 
411 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
363 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  31.96 
 
 
350 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  32.16 
 
 
394 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  30.08 
 
 
393 aa  159  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 
383 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  31.48 
 
 
394 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  33.13 
 
 
374 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 
370 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
383 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  29.47 
 
 
370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 
370 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
386 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.47 
 
 
370 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
370 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
370 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
370 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
370 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 
373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  28.61 
 
 
372 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  29.58 
 
 
374 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 
370 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 
366 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  25.37 
 
 
367 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  29.63 
 
 
387 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
359 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 
370 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  28.5 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 
372 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  29.04 
 
 
366 aa  137  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  28.77 
 
 
362 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  31.3 
 
 
380 aa  135  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 
372 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  28.53 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  31.03 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  30.7 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  29.85 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  27.46 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  29.47 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  26.18 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  26.47 
 
 
371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 
366 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  32.2 
 
 
364 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  30.29 
 
 
391 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  25.59 
 
 
371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  28.84 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  29.67 
 
 
365 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  29.32 
 
 
362 aa  133  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  29.17 
 
 
366 aa  132  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.45 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  29.82 
 
 
362 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  27.9 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  27.41 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  28.28 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  26.18 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.79 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
348 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
351 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  29 
 
 
355 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  26.95 
 
 
362 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  27.38 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  27.16 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  29.19 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  29.56 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  26.72 
 
 
357 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  27.49 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.31 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  28.06 
 
 
373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  26.43 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  29.79 
 
 
359 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 
362 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 
353 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  27.38 
 
 
358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>