More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2051 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  95.43 
 
 		 394 aa  756    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 394 aa  809    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  39.27 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  41.35 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  37.79 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  30.49 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  30.21 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  32.16 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  29.09 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 		 370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  29 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  30.39 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  32.7 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  27.72 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  28.89 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  27.86 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  30.14 
 
 		 374 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 		 362 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  29.48 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 373 aa  143  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 		 383 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  28.97 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 		 373 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  29.67 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  29.85 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  29.31 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  27.93 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  28.02 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  28.91 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  27.54 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  27.73 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  28.04 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  26.65 
 
 		 380 aa  130  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  29.52 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  29.72 
 
 		 369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  26.5 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  29.46 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.63 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  28.19 
 
 		 366 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  29.32 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 370 aa  125  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  27.67 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  28 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  28.91 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  28.17 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  27.99 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  28.82 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1590  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  27.9 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  27.41 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  27.76 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  27.73 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  25.9 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  29.26 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  27.79 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  28.02 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 		 353 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  27.47 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  27.68 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  25.44 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  26.47 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  29.25 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02151  aminotransferases class-I  26.91 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  27.94 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>