More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01458 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  100 
 
 
391 aa  801    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 
379 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  38.55 
 
 
390 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  36.86 
 
 
395 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  32.11 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
393 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 
390 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  32.65 
 
 
370 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
386 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  29.03 
 
 
377 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  34.42 
 
 
370 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  31.72 
 
 
411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
369 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 
374 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 
394 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  34.31 
 
 
376 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  30.32 
 
 
350 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  34.21 
 
 
374 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 
353 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  32.18 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  34.87 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  29.66 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  33.22 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  32.28 
 
 
363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
369 aa  140  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
374 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
362 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
357 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 
353 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  29.48 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
370 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 
352 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 
373 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 
370 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.38 
 
 
392 aa  136  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
375 aa  136  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  29.04 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  29.85 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  31.39 
 
 
355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  32.71 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
370 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 
375 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
366 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 
374 aa  133  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
370 aa  132  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  28.94 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  31.59 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  29.51 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 
366 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  31.46 
 
 
342 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 
380 aa  131  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1590  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0339  histidinol-phosphate aminotransferase  28.94 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  33.78 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 
355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  28.92 
 
 
374 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  30.15 
 
 
366 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
357 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.15 
 
 
366 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  30.9 
 
 
362 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  32.15 
 
 
391 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  26.04 
 
 
367 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  33.11 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  29.26 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
370 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  30.57 
 
 
353 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  32.65 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  32.15 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 
370 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>