More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  100 
 
 
374 aa  765    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  87.17 
 
 
373 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  44.77 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  45.84 
 
 
374 aa  296  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  34.07 
 
 
367 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  31.1 
 
 
395 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  28.76 
 
 
390 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  30.67 
 
 
393 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 
394 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  31.72 
 
 
411 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  30.14 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  29.53 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 
379 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 
383 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  36.3 
 
 
356 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  33.02 
 
 
370 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.15 
 
 
362 aa  145  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  35.47 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  33.02 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
370 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  29.27 
 
 
370 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  32.53 
 
 
391 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
371 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
383 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
370 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  28.92 
 
 
391 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  30.42 
 
 
342 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  32.23 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  29.39 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  28.01 
 
 
370 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.71 
 
 
370 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  28.39 
 
 
370 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 
355 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  26.65 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  31.69 
 
 
370 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  31.03 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  31.68 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  31.35 
 
 
362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  30.43 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  27.69 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  28.27 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  29.19 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  31.65 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  29.66 
 
 
392 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  33.02 
 
 
351 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  32.48 
 
 
360 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.3 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  27.47 
 
 
358 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
360 aa  126  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  32.05 
 
 
374 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  31.6 
 
 
374 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.52 
 
 
383 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 
365 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  26.65 
 
 
366 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
376 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  26.33 
 
 
366 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  29.1 
 
 
366 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  31.17 
 
 
369 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  32.09 
 
 
374 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  26.33 
 
 
366 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  26.33 
 
 
366 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  26.33 
 
 
366 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  25.99 
 
 
367 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  26.02 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  26.02 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  27.97 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  28.71 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.85 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  31.72 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0635  histidinol-phosphate aminotransferase  28.1 
 
 
377 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  29.1 
 
 
355 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  30.77 
 
 
372 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0630  histidinol-phosphate aminotransferase  28.1 
 
 
404 aa  119  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  31.44 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  26.77 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  28.39 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.43 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  29.31 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  25.71 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  33.33 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  26.41 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  30.03 
 
 
366 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
362 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  31.93 
 
 
344 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  31.5 
 
 
358 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  31.5 
 
 
358 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  25.71 
 
 
366 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  28.41 
 
 
371 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>