More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2352 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  100 
 
 
394 aa  809    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  95.43 
 
 
394 aa  755    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  39.82 
 
 
383 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  37.97 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  38.66 
 
 
350 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
393 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  30.49 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  31.48 
 
 
379 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 
395 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 
390 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  28.83 
 
 
387 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
370 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  30.49 
 
 
391 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  29 
 
 
386 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  27.98 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  32.16 
 
 
374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  28.02 
 
 
367 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
362 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  28.89 
 
 
372 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  31.15 
 
 
383 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  29.86 
 
 
374 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  30.22 
 
 
373 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  28.66 
 
 
373 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  29.85 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
363 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  29.08 
 
 
389 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.4 
 
 
370 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  31.91 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.4 
 
 
370 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  28.06 
 
 
380 aa  130  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  28.96 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  31.61 
 
 
374 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  27.51 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  28.19 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  27.41 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  27.76 
 
 
377 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  27.16 
 
 
380 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  28.91 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 
374 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
362 aa  127  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
370 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  29.45 
 
 
370 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  29.82 
 
 
342 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  28.7 
 
 
373 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  29.76 
 
 
365 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 
366 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 
362 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  29.66 
 
 
370 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  28.19 
 
 
366 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
374 aa  124  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  28.91 
 
 
379 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  32.28 
 
 
385 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  29.34 
 
 
357 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  26.76 
 
 
369 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  28.18 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  26.81 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  27.38 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  27.67 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  28.35 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 
374 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  27.86 
 
 
369 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  29.62 
 
 
372 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  28.19 
 
 
366 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 
356 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 
362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  27.98 
 
 
370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  28.35 
 
 
351 aa  120  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 
366 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  28.62 
 
 
365 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  28.62 
 
 
365 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  27.54 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  27 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  27.54 
 
 
371 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
352 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  27.3 
 
 
366 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  30.18 
 
 
375 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  27.55 
 
 
370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 
367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  28.09 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  28.92 
 
 
352 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  28.92 
 
 
352 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>