More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6129 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  100 
 
 
390 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  39.59 
 
 
395 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  39.33 
 
 
390 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 
379 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  34.46 
 
 
367 aa  205  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
370 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  31.21 
 
 
367 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.66 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  33.93 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  32.82 
 
 
383 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  32.04 
 
 
387 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
370 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
371 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  34.85 
 
 
365 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  31.42 
 
 
369 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
374 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.52 
 
 
372 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  33.93 
 
 
374 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  33.33 
 
 
391 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 
358 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  30.93 
 
 
386 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  29.87 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.02 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  30.18 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 
394 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  33.93 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  29.59 
 
 
374 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  29.72 
 
 
392 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  32.63 
 
 
373 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  31.97 
 
 
342 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
374 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.98 
 
 
362 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  31.99 
 
 
370 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
369 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  32.31 
 
 
351 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 
374 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 
411 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  28.11 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  28.19 
 
 
370 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
378 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  30.61 
 
 
370 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0695  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 
372 aa  139  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.736115  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6316  histidinol-phosphate aminotransferase  27.04 
 
 
370 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  31.8 
 
 
371 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  29.53 
 
 
374 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1583  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
373 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
362 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 
369 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
365 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
363 aa  136  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 
374 aa  136  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  29 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  30.24 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  29.12 
 
 
371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  30.96 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  28.79 
 
 
373 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  30.79 
 
 
391 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  28.02 
 
 
361 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  30.37 
 
 
373 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  31.09 
 
 
376 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  31.42 
 
 
355 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
373 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 
365 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  26.87 
 
 
370 aa  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  27.61 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  31.38 
 
 
359 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.08 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  31.06 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3006  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  30.5 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  31.29 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  31.48 
 
 
352 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  30.46 
 
 
360 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  27.45 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  27.09 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 
365 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  28.87 
 
 
385 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  27.86 
 
 
381 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0652  histidinol-phosphate aminotransferase  29.2 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  29.46 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2887  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  28.31 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  29.73 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>