More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0652 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0652  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
381 aa  758    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3083  histidinol-phosphate aminotransferase  67.72 
 
 
367 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1981  histidinol-phosphate aminotransferase  66.12 
 
 
370 aa  471  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0694  histidinol-phosphate aminotransferase  66.76 
 
 
367 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.843102  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1984  histidinol-phosphate aminotransferase  65.91 
 
 
381 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3473  histidinol-phosphate aminotransferase  62.99 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2088  histidinol-phosphate aminotransferase  62.67 
 
 
372 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0665  histidinol-phosphate aminotransferase  56.33 
 
 
373 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2648  histidinol-phosphate aminotransferase  53.48 
 
 
376 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0635  histidinol-phosphate aminotransferase  52.89 
 
 
377 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.532524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 
370 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0630  histidinol-phosphate aminotransferase  52.89 
 
 
404 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538864  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1423  histidinol-phosphate aminotransferase  57.43 
 
 
357 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1120  histidinol-phosphate aminotransferase  54.74 
 
 
371 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0933  histidinol-phosphate aminotransferase  58.17 
 
 
371 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  35.13 
 
 
362 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  32.85 
 
 
386 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  36.34 
 
 
362 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
369 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3157  aminotransferase  37.57 
 
 
369 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  29.86 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  34.42 
 
 
370 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
370 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  34.13 
 
 
370 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  31.37 
 
 
367 aa  170  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  29.01 
 
 
351 aa  169  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
371 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
370 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 
370 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
370 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 
385 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  31.85 
 
 
373 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  36.78 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
370 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  32.25 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
370 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.17 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  35.38 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2284  histidinol-phosphate aminotransferase  33.85 
 
 
361 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.13 
 
 
392 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0959  histidinol-phosphate aminotransferase  33.85 
 
 
361 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00272091  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  35.46 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  33.03 
 
 
361 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 
370 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4034  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
364 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
369 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  30.99 
 
 
389 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 
370 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
374 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  33.85 
 
 
362 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
374 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.82 
 
 
369 aa  159  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  32.46 
 
 
364 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  26.18 
 
 
366 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  28.12 
 
 
352 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  28.12 
 
 
352 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  35.87 
 
 
365 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 
366 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  34.64 
 
 
369 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
363 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 
368 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  36.49 
 
 
365 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  33.55 
 
 
360 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  28.09 
 
 
367 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3575  histidinol-phosphate aminotransferase  33.91 
 
 
374 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.522328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
370 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  35.24 
 
 
371 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
377 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
362 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 
371 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 
366 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  25.59 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3457  aminotransferase  36.14 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.247357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  25.94 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  29.21 
 
 
370 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  31.79 
 
 
368 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  35.35 
 
 
374 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.52 
 
 
370 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 
370 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 
380 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  31.23 
 
 
369 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  31.55 
 
 
369 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  30.61 
 
 
372 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  32.07 
 
 
366 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  25.59 
 
 
366 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  25.23 
 
 
366 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  30.34 
 
 
369 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  34.43 
 
 
376 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
366 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
366 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  30.63 
 
 
365 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
373 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
366 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
365 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>