More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3654 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3654  aminotransferase class I and II  100 
 
 
411 aa  840    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4751  aminotransferase class I and II  75.46 
 
 
383 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000197662  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  42 
 
 
350 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2051  aminotransferase class I and II  40 
 
 
394 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2352  aminotransferase class I and II  39.24 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.218999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
386 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  34.2 
 
 
363 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  31.44 
 
 
372 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  32.64 
 
 
383 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 
370 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  34.15 
 
 
373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  29.16 
 
 
390 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3478  aminotransferase class I and II  28.87 
 
 
379 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.53524  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2584  putative aminotransferase  34.32 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975598  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  32.41 
 
 
362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  32.81 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 
386 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2627  aminotransferase class I and II  31.72 
 
 
395 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  27.78 
 
 
367 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 
365 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 
388 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
365 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 
365 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  32.13 
 
 
365 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
370 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  31.25 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.6 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01458  putative aminotransferase  31.13 
 
 
391 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  34.03 
 
 
348 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  32.72 
 
 
352 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  32.72 
 
 
352 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  31.49 
 
 
370 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  30.89 
 
 
363 aa  151  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.95 
 
 
373 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  31.19 
 
 
351 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
369 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
374 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
374 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
370 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
370 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
374 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
370 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
370 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
370 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
365 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  28.97 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  29.86 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  29.83 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3031  putative aminotransferase  29.79 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
348 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  30.82 
 
 
370 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
374 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 
365 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 
377 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  31.38 
 
 
366 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  31.38 
 
 
366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  31.38 
 
 
366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 
366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31820  putative aminotransferase  31.38 
 
 
374 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.437419  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
362 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  32.49 
 
 
376 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
366 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  30.92 
 
 
366 aa  145  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  31.92 
 
 
371 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
350 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2705  putative aminotransferase  30.09 
 
 
373 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  31.08 
 
 
366 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6129  aminotransferase class I and II  27.23 
 
 
390 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.849535  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  28.4 
 
 
373 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
366 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  30.46 
 
 
366 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  32.75 
 
 
370 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  32.94 
 
 
348 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  32.17 
 
 
374 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  27.92 
 
 
367 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
374 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
350 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  29.76 
 
 
369 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  30.2 
 
 
375 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.38 
 
 
371 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  28.24 
 
 
374 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  31.7 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3575  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.522328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
352 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 
364 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  27.71 
 
 
362 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>