More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4029 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  84.41 
 
 
372 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  100 
 
 
372 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  60.27 
 
 
366 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  51.4 
 
 
370 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  50.81 
 
 
376 aa  349  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  52.15 
 
 
356 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  52.99 
 
 
356 aa  342  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  49.17 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  50.41 
 
 
367 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  49.58 
 
 
362 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  51.98 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  51.9 
 
 
357 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  45.94 
 
 
365 aa  316  4e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  48.71 
 
 
352 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  46.43 
 
 
363 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  49.15 
 
 
372 aa  305  9.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  46.48 
 
 
359 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  48.71 
 
 
353 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  47.32 
 
 
360 aa  300  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  48.17 
 
 
359 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  46.91 
 
 
355 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  47.73 
 
 
369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  46.11 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  44.72 
 
 
369 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  43.05 
 
 
358 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  43.05 
 
 
358 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  43.05 
 
 
358 aa  272  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  43.58 
 
 
363 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  46.78 
 
 
351 aa  269  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  45.3 
 
 
370 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  44.54 
 
 
360 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  43.14 
 
 
351 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  45.33 
 
 
356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  42.66 
 
 
353 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  41.39 
 
 
360 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  43.24 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  44.67 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  45.06 
 
 
367 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  42.9 
 
 
333 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  37.46 
 
 
373 aa  215  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  35.55 
 
 
353 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  35.84 
 
 
353 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  35.84 
 
 
353 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  38.71 
 
 
362 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
370 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  36.49 
 
 
372 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  37.88 
 
 
370 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1355  aminotransferase, class I and II  40.66 
 
 
343 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 
362 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  34.75 
 
 
369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  35.34 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
351 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1329  aminotransferase class I and II  35.47 
 
 
345 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 
367 aa  180  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  36.52 
 
 
370 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  38.61 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  34.92 
 
 
370 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
374 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
364 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  36.97 
 
 
371 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 
374 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 
370 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  36.86 
 
 
374 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
365 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
370 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
370 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.79 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  35.44 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  36.74 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  36.19 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  34.4 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 
366 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  33.42 
 
 
365 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 
365 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
370 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
366 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  34.14 
 
 
392 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
374 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
362 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
370 aa  170  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.36 
 
 
365 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  36.02 
 
 
386 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  30.66 
 
 
366 aa  169  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
352 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
352 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  32.9 
 
 
377 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  34.81 
 
 
362 aa  169  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 
364 aa  169  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>