More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4252 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
367 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  92.13 
 
 
367 aa  604  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  69.8 
 
 
360 aa  478  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  60.91 
 
 
370 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  58.59 
 
 
351 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  56.86 
 
 
355 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 
360 aa  359  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  54 
 
 
356 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  54.62 
 
 
352 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  50.95 
 
 
391 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  54.26 
 
 
353 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  53.28 
 
 
359 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  52.17 
 
 
363 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  52.96 
 
 
359 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  52.21 
 
 
376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  51.75 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  52.25 
 
 
355 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  49.59 
 
 
362 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  49.31 
 
 
358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  49.31 
 
 
358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  51 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  49.03 
 
 
358 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  50.29 
 
 
360 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  51.42 
 
 
372 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  52.15 
 
 
356 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  51.16 
 
 
359 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  48.56 
 
 
353 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  48.35 
 
 
367 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  48.43 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  47.47 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  45.79 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  46.4 
 
 
369 aa  281  9e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  47.85 
 
 
357 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  46.96 
 
 
372 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  45.61 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  43.06 
 
 
365 aa  272  8.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  44.73 
 
 
372 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  38.44 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  39.26 
 
 
373 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  44.38 
 
 
362 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  36.41 
 
 
372 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
362 aa  222  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  39.44 
 
 
370 aa  222  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  42.66 
 
 
362 aa  222  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  40.27 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  41.36 
 
 
370 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  40.79 
 
 
370 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  41.67 
 
 
369 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  41.48 
 
 
383 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  41.23 
 
 
363 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  41.48 
 
 
365 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  41.64 
 
 
364 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  40.45 
 
 
374 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  41.08 
 
 
371 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
369 aa  215  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  39.18 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  41.08 
 
 
376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.99 
 
 
392 aa  212  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  41.85 
 
 
369 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  40.75 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  40.74 
 
 
369 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  34.96 
 
 
366 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
351 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 
366 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
385 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  40.23 
 
 
374 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  40.81 
 
 
379 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 
370 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
370 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  42.29 
 
 
370 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  40.34 
 
 
374 aa  205  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  38.57 
 
 
386 aa  205  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  41.01 
 
 
369 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  36.46 
 
 
374 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 
366 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 
366 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  38.2 
 
 
374 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  41.34 
 
 
365 aa  203  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  41.34 
 
 
365 aa  203  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  40.27 
 
 
373 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  39.89 
 
 
381 aa  202  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
366 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  34.76 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  38.62 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  40.94 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  38.98 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
366 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
366 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  43.11 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  37.92 
 
 
371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
370 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
370 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
370 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 
358 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  38.62 
 
 
374 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  35.23 
 
 
370 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>