More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4386 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4386  aminotransferase class I and II  100 
 
 
333 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.933282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  48.77 
 
 
352 aa  270  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  45.68 
 
 
356 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  45.82 
 
 
359 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
355 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  45.6 
 
 
353 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  42.9 
 
 
372 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  46.75 
 
 
359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  48.02 
 
 
356 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  45.26 
 
 
351 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  42.73 
 
 
391 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  46.18 
 
 
370 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  41.9 
 
 
370 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  42.6 
 
 
372 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  43.21 
 
 
360 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  44.71 
 
 
357 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  43.32 
 
 
366 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  42.77 
 
 
376 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  46.08 
 
 
359 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  40.3 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  40.3 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  41.12 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  40 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  37.54 
 
 
365 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  39.32 
 
 
351 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  40.92 
 
 
360 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  42.25 
 
 
362 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  39.33 
 
 
353 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  41.03 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  43.64 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  37.31 
 
 
363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  42.14 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  41.72 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  42.86 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  42.61 
 
 
365 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  41.3 
 
 
369 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0303  histidinol-phosphate aminotransferase  43.64 
 
 
356 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  37.16 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  40.95 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  41.96 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  32.52 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  37.38 
 
 
365 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 
370 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  33.04 
 
 
370 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
370 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  35.91 
 
 
353 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  34.04 
 
 
386 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  35.91 
 
 
353 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  36.62 
 
 
370 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  35.91 
 
 
353 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 
351 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
370 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
370 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  35.38 
 
 
362 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
370 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
370 aa  155  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  32.73 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1386  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 
368 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
373 aa  152  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0726  histidinol phosphate aminotransferase  40.88 
 
 
351 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  37.57 
 
 
374 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 
383 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 
370 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  36.78 
 
 
374 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
392 aa  149  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  31.56 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  36.11 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 
363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  34.94 
 
 
362 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
369 aa  145  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  35.89 
 
 
362 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
360 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
374 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1355  aminotransferase, class I and II  36.54 
 
 
343 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 
378 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  30.91 
 
 
372 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  35.33 
 
 
370 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  30.28 
 
 
358 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  37.01 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.78 
 
 
358 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  35.76 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  35.06 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
366 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.27 
 
 
370 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  31.83 
 
 
371 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  29.77 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  35.22 
 
 
371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
370 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 
366 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  35.03 
 
 
386 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
369 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  34.04 
 
 
372 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>