More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1329 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1329  aminotransferase class I and II  100 
 
 
345 aa  671    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.519035  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  40.12 
 
 
353 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  40.12 
 
 
353 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  40.12 
 
 
353 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1077  histidinol-phosphate aminotransferase  40.6 
 
 
369 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  39.52 
 
 
369 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02340  aminotransferase  36.47 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4642  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  40.7 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  36.9 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1355  aminotransferase, class I and II  41.28 
 
 
343 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  38.24 
 
 
391 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4029  aminotransferase  35.47 
 
 
372 aa  186  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0166  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 
352 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  0.633959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  36.25 
 
 
362 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  39.46 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35930  aminotransferase  36.78 
 
 
367 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4514  aminotransferase  37.31 
 
 
356 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.550747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0146  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
355 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4291  histidinol-phosphate aminotransferase  37.99 
 
 
376 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3018  putative aminotransferase  36.9 
 
 
359 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3395  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 
359 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.822493  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
370 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  35.56 
 
 
363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3969  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20100  aminotransferase  34.41 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 
370 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5611  putative aminotransferase  35.06 
 
 
351 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
370 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0302  histidinol-phosphate aminotransferase  37.12 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  32.15 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0764  histidinol-phosphate aminotransferase  34.95 
 
 
352 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0747  histidinol-phosphate aminotransferase  34.95 
 
 
352 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  32.24 
 
 
370 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0381  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 
353 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4408  histidinol-phosphate aminotransferase  38.24 
 
 
370 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0190  histidinol-phosphate aminotransferase  35.49 
 
 
360 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 
362 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  32.04 
 
 
370 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  36.31 
 
 
363 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  32.16 
 
 
351 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  31.19 
 
 
366 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01830  aminotransferase  35.54 
 
 
351 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  33.54 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  30.65 
 
 
366 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0289  histidinol-phosphate aminotransferase  35.38 
 
 
360 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1862  aminotransferase  34.39 
 
 
365 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4982  putative aminotransferase  35.17 
 
 
358 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 
365 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5070  putative aminotransferase  35.17 
 
 
358 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 
366 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24092e-22 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5363  putative aminotransferase  34.83 
 
 
358 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 
374 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1195  putative aminotransferase  36.04 
 
 
360 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 
370 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2746  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
366 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
366 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
366 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 
370 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  30.27 
 
 
366 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 
366 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  30.49 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13806  putative aminotransferase  35.9 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918765  normal  0.733374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  31.64 
 
 
370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4252  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 
367 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.235656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4682  histidinol-phosphate aminotransferase  37.69 
 
 
367 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120317  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2675  histidinol-phosphate aminotransferase  30.27 
 
 
366 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  30.59 
 
 
373 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  35.08 
 
 
376 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  36.09 
 
 
365 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
371 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  28.79 
 
 
367 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 
370 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  31.63 
 
 
363 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
374 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  38.72 
 
 
379 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  30.82 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01039  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  35.5 
 
 
369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  30.19 
 
 
357 aa  139  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 
389 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  32.74 
 
 
385 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
374 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  35.4 
 
 
369 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  32.83 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  28.32 
 
 
369 aa  136  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  35.74 
 
 
362 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0235  histidinol-phosphate transaminase  30.15 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0726  histidinol phosphate aminotransferase  35.51 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  29.9 
 
 
358 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
370 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0082  aminotransferase class I and II  30.96 
 
 
390 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>