More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27901 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  100 
 
 
360 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  58.36 
 
 
371 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  64.86 
 
 
357 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  62.43 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  50.71 
 
 
360 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  50.71 
 
 
360 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  46.13 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  43.99 
 
 
374 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  44.28 
 
 
374 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  44.57 
 
 
373 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  40.66 
 
 
366 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.4 
 
 
351 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  44.26 
 
 
357 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.46 
 
 
352 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  40 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  40.17 
 
 
368 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.06 
 
 
364 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.38 
 
 
362 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.88 
 
 
375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.89 
 
 
366 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.67 
 
 
370 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.14 
 
 
358 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.8 
 
 
399 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.97 
 
 
357 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.11 
 
 
379 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  27.27 
 
 
354 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.02 
 
 
361 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  27.27 
 
 
354 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 
364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  31.91 
 
 
364 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  31.65 
 
 
364 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  31.65 
 
 
364 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  33.05 
 
 
361 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  31.65 
 
 
364 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  31.38 
 
 
364 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.67 
 
 
360 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.77 
 
 
362 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  25.58 
 
 
359 aa  153  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  30.79 
 
 
852 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.37 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.95 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.23 
 
 
498 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 
378 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.43 
 
 
362 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 
357 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.85 
 
 
372 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  30.75 
 
 
863 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  30.6 
 
 
864 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  28.83 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.64 
 
 
360 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  27.45 
 
 
369 aa  129  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  26.43 
 
 
363 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.72 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.23 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.1 
 
 
362 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  27.07 
 
 
373 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  29.4 
 
 
332 aa  126  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  23.89 
 
 
356 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.25 
 
 
364 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 
363 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  27.46 
 
 
371 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  24.56 
 
 
351 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.19 
 
 
359 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 
355 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 
362 aa  122  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.53 
 
 
361 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.3 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  28.25 
 
 
863 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  31.85 
 
 
357 aa  119  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  26.24 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  26.24 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.94 
 
 
348 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  23.66 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  25.9 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.54 
 
 
498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  28.94 
 
 
385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  23.43 
 
 
358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 
349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  28.05 
 
 
362 aa  116  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  33.1 
 
 
357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  25.41 
 
 
334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.61 
 
 
352 aa  115  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  27.5 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  28.67 
 
 
372 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.24 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  27.27 
 
 
399 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  25.54 
 
 
356 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  27.53 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  31.3 
 
 
346 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  31.13 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
339 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.66 
 
 
373 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  28.99 
 
 
357 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  28.9 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  27.39 
 
 
342 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  27.83 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  27.24 
 
 
364 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  34.55 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>