More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3097 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 363 aa  712    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  53.09 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  53.09 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  53.09 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  50.61 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  50.15 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.65 
 
 		 848 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  47.65 
 
 		 336 aa  246  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1321  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  50.31 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  48.55 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  47.18 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  47.09 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  47.85 
 
 		 366 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.76 
 
 		 807 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.16 
 
 		 803 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  30.23 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.06 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  33.64 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.9 
 
 		 370 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  30.41 
 
 		 863 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  22.92 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.3 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  22.55 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  29.28 
 
 		 340 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.66 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  31.4 
 
 		 864 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.73 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.33 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  34.55 
 
 		 360 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  29.88 
 
 		 863 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.12 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.63 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.33 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  27.14 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  33.73 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.46 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.57 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  23.85 
 
 		 373 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  23.75 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.52 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.71 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  30.77 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  25.75 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.32 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.25 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  23.73 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.47 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  33.43 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  27.94 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  27.19 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.71 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  29.24 
 
 		 364 aa  95.9  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  29.53 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.04 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  28.95 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.66 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  29.53 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.27 
 
 		 498 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.88 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.99 
 
 		 364 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  24.3 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  28.65 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  25.57 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  26.98 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  24.43 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.68 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.08 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  27.41 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.99 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  28.32 
 
 		 367 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  29.71 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.79 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  26.26 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  24.33 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.76 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  36.22 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  27.11 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  30.97 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  27.99 
 
 		 852 aa  87.4  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1935  aminotransferase, class I and II  29.56 
 
 		 390 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2182  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.83 
 
 		 323 aa  86.3  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.243931  hitchhiker  0.000290112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  24.01 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  25.4 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.89 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  26.11 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.22 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  25.31 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  29.04 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.2 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  30.94 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  27.38 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  33.72 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  32.1 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  27.13 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>