More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3407 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  68.48 
 
 
364 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  52.65 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  53.09 
 
 
363 aa  285  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.38 
 
 
848 aa  268  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  54.06 
 
 
358 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  56.89 
 
 
347 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  50.31 
 
 
343 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  54.21 
 
 
336 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  52.69 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1321  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  52.52 
 
 
345 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.23 
 
 
807 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.74 
 
 
803 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  50.3 
 
 
366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  36.12 
 
 
346 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.16 
 
 
360 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  33.64 
 
 
864 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  31.69 
 
 
863 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  33.53 
 
 
852 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.99 
 
 
379 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.99 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  29.67 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.31 
 
 
375 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  24.85 
 
 
354 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.32 
 
 
357 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  24.56 
 
 
354 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.7 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.92 
 
 
399 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  31.31 
 
 
357 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.19 
 
 
359 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.18 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  30 
 
 
863 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.32 
 
 
358 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 
340 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 
362 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.98 
 
 
498 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2182  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.38 
 
 
323 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.243931  hitchhiker  0.000290112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  30 
 
 
366 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.08 
 
 
361 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 
360 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.81 
 
 
351 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.54 
 
 
352 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.08 
 
 
366 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.35 
 
 
364 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  29.91 
 
 
364 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  29.91 
 
 
364 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  29.91 
 
 
364 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  25.98 
 
 
359 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.21 
 
 
364 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.9 
 
 
372 aa  99.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  35.8 
 
 
320 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  29.91 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  34.56 
 
 
343 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  26.86 
 
 
378 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.81 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.33 
 
 
362 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  27.38 
 
 
360 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  34.06 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.14 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.66 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.39 
 
 
362 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  25.22 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.27 
 
 
498 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  29.73 
 
 
332 aa  93.2  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  26.06 
 
 
363 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.98 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  28.75 
 
 
383 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  27.22 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.23 
 
 
332 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  31.4 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  27.33 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.76 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.75 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 
357 aa  90.1  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  20.71 
 
 
358 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.85 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  26.32 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.09 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  20.41 
 
 
358 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  25.24 
 
 
374 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  26.24 
 
 
368 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  30.95 
 
 
858 aa  86.7  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  35.35 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.96 
 
 
357 aa  85.9  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  33.49 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.97 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.07 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.92 
 
 
374 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  28.51 
 
 
353 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  29.05 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  29.63 
 
 
392 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  26.64 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
360 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  29.15 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  29.65 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  28.46 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  27.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>