More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6030 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  100 
 
 
343 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  60.41 
 
 
345 aa  362  6e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1321  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  64.22 
 
 
345 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  64.17 
 
 
336 aa  332  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.75 
 
 
848 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  57.31 
 
 
396 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  60.37 
 
 
358 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  57.23 
 
 
366 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.47 
 
 
807 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  53.98 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.29 
 
 
803 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  50.31 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  50.31 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  50.31 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  49.84 
 
 
364 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  44.95 
 
 
363 aa  209  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  26.74 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  33.44 
 
 
863 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  33.73 
 
 
346 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  25.84 
 
 
354 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.05 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  32.84 
 
 
342 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  34.7 
 
 
863 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.38 
 
 
399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  27.09 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  23.18 
 
 
362 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  33.63 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  33.06 
 
 
864 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.55 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.02 
 
 
379 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.31 
 
 
357 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.95 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  33.83 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.3 
 
 
361 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  28.49 
 
 
340 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.31 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.11 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.86 
 
 
368 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.86 
 
 
368 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  30.89 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  29.3 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.86 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  26.63 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  22.95 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  22.66 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.11 
 
 
358 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  34.28 
 
 
852 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  29.45 
 
 
364 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.21 
 
 
368 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  32.81 
 
 
858 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.79 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  28.41 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.81 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  26.35 
 
 
360 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  28.96 
 
 
364 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.87 
 
 
498 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  29.27 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  29.27 
 
 
364 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.76 
 
 
374 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  28.96 
 
 
364 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.53 
 
 
364 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  25.16 
 
 
374 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  27.25 
 
 
378 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  26.22 
 
 
358 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.18 
 
 
366 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  31.91 
 
 
350 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  26.09 
 
 
358 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.7 
 
 
362 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  26.71 
 
 
353 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  32.81 
 
 
361 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.92 
 
 
352 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 
356 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  29.03 
 
 
339 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.45 
 
 
357 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.74 
 
 
362 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.46 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.16 
 
 
342 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  25.69 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  30.55 
 
 
368 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.56 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.08 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  23.68 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  35.63 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  27.04 
 
 
361 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.36 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 
351 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
356 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  30.29 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 
371 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.91 
 
 
361 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  29.7 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.24 
 
 
498 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  28.24 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  30.26 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>