More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12260 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  68.48 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  68.48 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  68.48 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  56.43 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  56.71 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  50.61 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.39 
 
 		 848 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  51.95 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.08 
 
 		 807 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  54.23 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  49.84 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.07 
 
 		 803 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1321  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  51.42 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155634  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  50.45 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  50.76 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  34.8 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  33.93 
 
 		 864 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  32.64 
 
 		 852 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  30.32 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.12 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.64 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  25.78 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.65 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  25.31 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.65 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.9 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.43 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.47 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.5 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  28.14 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.41 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  30.4 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  30.79 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  30.79 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.9 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  27.19 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  31 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  30.28 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.13 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.31 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  28.96 
 
 		 863 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31 
 
 		 364 aa  95.9  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.68 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.56 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.83 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.08 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  29.75 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  26.84 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  25 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.02 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  30.72 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.39 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  26.04 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  29.1 
 
 		 863 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  26.67 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.18 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.01 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  28 
 
 		 357 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.69 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.05 
 
 		 498 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  32.03 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  28.36 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  29.97 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.85 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.44 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.38 
 
 		 364 aa  86.7  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  26.28 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  24.03 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  24.84 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2182  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.06 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.243931  hitchhiker  0.000290112 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  30.21 
 
 		 858 aa  84  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  29.67 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  27.94 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  27.94 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  27.5 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.03 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  26.47 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  29.57 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  31.43 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  27.21 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.5 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  30.55 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2149  putative histidinol-phosphate aminotransferase  28.76 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000106616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  27.21 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.13 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  28.62 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.47 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  29.18 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2213  histidinol-phosphate aminotransferase  32.26 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  32.9 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  33.87 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2013  putative histidinol-phosphate aminotransferase HisC  28.76 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  27.21 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1993  histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase and cobyric acid decarboxylase  28.76 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  27.21 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>