More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  100 
 
 		 353 aa  687    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  61.73 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  64.62 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  63.19 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  62.65 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  62.65 
 
 		 331 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  57.58 
 
 		 334 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  61.28 
 
 		 336 aa  359  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  59.7 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  64.62 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  64 
 
 		 330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  58.9 
 
 		 329 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  59.63 
 
 		 341 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  57.85 
 
 		 328 aa  319  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  54.93 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  51.53 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  60.49 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  51.67 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  49.85 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  50.45 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  54.85 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  50.88 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  51.51 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  50.75 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  52.25 
 
 		 341 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  50.6 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  49.55 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  49.25 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  54.08 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  51.66 
 
 		 339 aa  255  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  50.3 
 
 		 335 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.78 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  51.51 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.78 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  52.07 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  41.71 
 
 		 372 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.15 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.31 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.31 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.31 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  51.19 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.31 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.01 
 
 		 350 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  53.01 
 
 		 350 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  44.69 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  40.23 
 
 		 350 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  41.96 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.65 
 
 		 329 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  43.5 
 
 		 343 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  46.44 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  43.88 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.88 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  45.29 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.74 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  43.84 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.47 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  43.64 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.99 
 
 		 519 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  42.64 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  43.29 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  43.24 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.18 
 
 		 329 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  45.43 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.54 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.99 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.77 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.73 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.37 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  41.19 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  36.36 
 
 		 344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.6 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  40.43 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.02 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.74 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  40.73 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.77 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  37.46 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  42.81 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  34.62 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  32.34 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.52 
 
 		 357 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.59 
 
 		 360 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.7 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  34.35 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  32.42 
 
 		 852 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  30.48 
 
 		 396 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  32.47 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  32.47 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.2 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.2 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  30.45 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.11 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.67 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.46 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.25 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.22 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.72 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>