More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3547 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  85.75 
 
 		 366 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  61.92 
 
 		 345 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  64.53 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  65.12 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.81 
 
 		 848 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1321  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  64.44 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  57.31 
 
 		 343 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.85 
 
 		 807 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  56.45 
 
 		 347 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.3 
 
 		 803 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  48.55 
 
 		 363 aa  258  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  52.69 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  52.69 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  52.69 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  50.45 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.19 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.45 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  32.17 
 
 		 863 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  32.44 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.25 
 
 		 362 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.31 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  31.44 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  36.39 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.43 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 		 340 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.03 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  32.56 
 
 		 863 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.27 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  36.12 
 
 		 350 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 		 368 aa  119  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.36 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.38 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.38 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.79 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  24.39 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  25.82 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  24.12 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  25.76 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  25.21 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.99 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1410  aminotransferase class I and II  29.82 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.44 
 
 		 372 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  40.41 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  32.95 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  29.77 
 
 		 858 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  29.26 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.32 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  31.52 
 
 		 864 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  32.49 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  22.19 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.41 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.78 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  22.26 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.84 
 
 		 342 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  29.77 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  30.06 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  28.87 
 
 		 852 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.86 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.06 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  23.35 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.38 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.97 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  29.19 
 
 		 364 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  28.95 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  28.05 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.07 
 
 		 360 aa  99.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  29.63 
 
 		 353 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  28.9 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  30.73 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  31.78 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  25 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  33.44 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  28.49 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  29.63 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  26 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  27.95 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  27.95 
 
 		 382 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.26 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  27.64 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.25 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  22.25 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.58 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  27.95 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  27.42 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  28.23 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  27.55 
 
 		 356 aa  94.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  32.09 
 
 		 360 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  33.02 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  28.85 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.72 
 
 		 356 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.28 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  27.32 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  34.56 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  27.89 
 
 		 356 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>