More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1849 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  100 
 
 
346 aa  684    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  38.22 
 
 
375 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.2 
 
 
366 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.54 
 
 
372 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  35.2 
 
 
863 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  35.31 
 
 
863 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.47 
 
 
399 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.13 
 
 
357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.7 
 
 
361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  37.09 
 
 
364 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.8 
 
 
359 aa  178  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  36.5 
 
 
364 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.31 
 
 
379 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  36.5 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  30.11 
 
 
354 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  36.2 
 
 
364 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.63 
 
 
360 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  29.83 
 
 
354 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.51 
 
 
370 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.49 
 
 
362 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  36.94 
 
 
852 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  36.52 
 
 
361 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.59 
 
 
348 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.56 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.25 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.55 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  33.71 
 
 
864 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.61 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.54 
 
 
351 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.29 
 
 
360 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  31.2 
 
 
363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.57 
 
 
361 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  29.4 
 
 
364 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  35.57 
 
 
357 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 
378 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  29.33 
 
 
342 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  24.55 
 
 
358 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  24.55 
 
 
358 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.6 
 
 
362 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 
357 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.1 
 
 
356 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  30.7 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  32.63 
 
 
339 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  29.59 
 
 
366 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.27 
 
 
356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  32.78 
 
 
858 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.76 
 
 
352 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  37.68 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  29.07 
 
 
368 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.9 
 
 
352 aa  135  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.17 
 
 
807 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.29 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  28.49 
 
 
334 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.93 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  29.18 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.03 
 
 
848 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.61 
 
 
368 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.61 
 
 
368 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  33.63 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  29.33 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  27.68 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
373 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.64 
 
 
357 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  30.17 
 
 
367 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  31.29 
 
 
383 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  32.37 
 
 
336 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.06 
 
 
368 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.34 
 
 
332 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 
346 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  36.12 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  36.12 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  36.12 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  31.2 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.96 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  25.51 
 
 
374 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  26.05 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2182  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.36 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.243931  hitchhiker  0.000290112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  29.94 
 
 
386 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  30.75 
 
 
349 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.86 
 
 
496 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  36.2 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  30.36 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  33.74 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  34.02 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  25.67 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  34.17 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  33.64 
 
 
363 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  30.12 
 
 
371 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.06 
 
 
364 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  26.97 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.56 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  26.65 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  25.37 
 
 
359 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.45 
 
 
498 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  23.9 
 
 
373 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  35.44 
 
 
358 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  31.3 
 
 
360 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.4 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>