More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0161 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
848 aa  1625    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.69 
 
 
807 aa  831    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.04 
 
 
803 aa  793    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0311  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  64.22 
 
 
474 aa  520  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2707  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.5 
 
 
452 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.93 
 
 
452 aa  465  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00158406  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08510  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) /cobyrinate a,c-diamide synthase  58.09 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.02 
 
 
456 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5883  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.25 
 
 
478 aa  442  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00172766  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.06 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.76 
 
 
475 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1311  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.64 
 
 
455 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0544  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.54 
 
 
461 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5859  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.26 
 
 
465 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2297  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.79 
 
 
557 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368045  normal  0.0207364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2056  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.87 
 
 
455 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.87 
 
 
454 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0638  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.56 
 
 
450 aa  375  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0937959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2119  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.87 
 
 
455 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0264172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.47 
 
 
551 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0028663  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2136  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51 
 
 
476 aa  371  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.68 
 
 
460 aa  372  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.68 
 
 
454 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1702  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.11 
 
 
441 aa  355  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559301  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12863  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.44 
 
 
457 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103301  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  57.56 
 
 
345 aa  341  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.07 
 
 
464 aa  333  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.16 
 
 
454 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1855  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.73 
 
 
456 aa  329  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0710806  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0635  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.65 
 
 
467 aa  325  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873806  normal  0.509374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  58.29 
 
 
396 aa  325  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  55.43 
 
 
343 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.51 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.76 
 
 
502 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0574  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.49 
 
 
467 aa  317  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.43 
 
 
465 aa  316  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1321  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  61.89 
 
 
345 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  57.51 
 
 
336 aa  313  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0926  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.74 
 
 
482 aa  312  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.01 
 
 
454 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 
464 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0224312  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.33 
 
 
454 aa  307  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  56.4 
 
 
366 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  57.93 
 
 
358 aa  303  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.66 
 
 
463 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0243  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.44 
 
 
463 aa  294  5e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.95 
 
 
462 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_135  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.66 
 
 
463 aa  292  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1500  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.83 
 
 
507 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.35762e-18 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.46 
 
 
474 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000112468  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1039  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  35.22 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000825855  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0431  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.03 
 
 
474 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21180  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) /cobyrinate a,c-diamide synthase  41.93 
 
 
466 aa  285  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.43 
 
 
492 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266489  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.62 
 
 
460 aa  281  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  54.96 
 
 
347 aa  277  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.39 
 
 
465 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000497962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1619  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.29 
 
 
524 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350332  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0470  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.87 
 
 
462 aa  272  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.57 
 
 
458 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0079  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.09 
 
 
450 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.786214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0348  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  35.39 
 
 
494 aa  270  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1850  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.87 
 
 
454 aa  267  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1628  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  41.45 
 
 
450 aa  266  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000140301  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4184  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.9 
 
 
460 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1179  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.77 
 
 
464 aa  264  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3894  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.91 
 
 
460 aa  263  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0538501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.23 
 
 
443 aa  262  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.54 
 
 
464 aa  261  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  51.38 
 
 
340 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  51.38 
 
 
340 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  51.38 
 
 
340 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.39 
 
 
489 aa  260  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.07 
 
 
460 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.53 
 
 
480 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  40.97 
 
 
457 aa  253  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1007  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.08 
 
 
442 aa  250  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3196  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.83 
 
 
475 aa  250  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0078  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.32 
 
 
469 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826564 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.69 
 
 
441 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.328334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1722  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  33.92 
 
 
454 aa  249  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  45.65 
 
 
363 aa  249  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2890  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.36 
 
 
463 aa  249  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.88 
 
 
450 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0100  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.29 
 
 
447 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1196  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
447 aa  248  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.73 
 
 
454 aa  248  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.605454  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2191  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  37.76 
 
 
452 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  49.39 
 
 
364 aa  247  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0722  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.84 
 
 
447 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1001  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.47 
 
 
467 aa  244  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1380  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.83 
 
 
452 aa  243  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2197  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.16 
 
 
472 aa  241  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.580658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0043  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  36.28 
 
 
429 aa  240  9e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000316853  normal  0.33186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2672  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.55 
 
 
467 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0220  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.91 
 
 
447 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09381  putative cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.62 
 
 
475 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101452 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0327  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.02 
 
 
440 aa  238  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.580612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>