More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2223 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  71.86 
 
 		 345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1321  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  70.62 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.155634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  64.17 
 
 		 343 aa  364  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  65.12 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  66.76 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.51 
 
 		 848 aa  348  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  61.9 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.49 
 
 		 807 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3356  hypothetical protein  54.83 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.909955  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3407  hypothetical protein  54.83 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3345  hypothetical protein  54.83 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  56.12 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2887  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.27 
 
 		 803 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  54.23 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3097  aminotransferase class I and II  47.94 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0483296  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  34.12 
 
 		 863 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.14 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  35.07 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  33.13 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  33.13 
 
 		 364 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  34.02 
 
 		 864 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  34.32 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.52 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  31.34 
 
 		 863 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  27.04 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  32.54 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  31.75 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.49 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  32.24 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  25.07 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  27.83 
 
 		 364 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.12 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  30.46 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.12 
 
 		 399 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  24.11 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.57 
 
 		 361 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  32.84 
 
 		 852 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.73 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.51 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.04 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  31.55 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.65 
 
 		 358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  28.45 
 
 		 366 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.45 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  32.54 
 
 		 858 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.06 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.75 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  27.18 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.18 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.9 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  33.82 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  28 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  36.09 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.41 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.15 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.69 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.41 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  25.95 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  27.03 
 
 		 352 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  21.19 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  21.19 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.12 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.17 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.28 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.93 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.94 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.56 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  32.56 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  33.43 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.47 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  27.3 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  29.52 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.89 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  25.89 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  25.63 
 
 		 378 aa  99.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  35.37 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  28.43 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  27.62 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.63 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.83 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  35.33 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.44 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  26.8 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.11 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.56 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.56 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  28.05 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  24.68 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  30.72 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  22.16 
 
 		 374 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  29.38 
 
 		 360 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  31.87 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.97 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>