More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0101 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  100 
 
 
331 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  54.91 
 
 
330 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  55.59 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  54.32 
 
 
336 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  53.23 
 
 
335 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  53.68 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  55.9 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  51.52 
 
 
334 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  55.28 
 
 
331 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  51.53 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  53.37 
 
 
330 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  51.82 
 
 
334 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  50 
 
 
329 aa  292  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  53.99 
 
 
330 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  50 
 
 
340 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  51.26 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  48.31 
 
 
348 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.69 
 
 
333 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  48.32 
 
 
341 aa  273  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  51.98 
 
 
343 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  45.97 
 
 
339 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  55.11 
 
 
321 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  49.39 
 
 
330 aa  261  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.09 
 
 
356 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.9 
 
 
335 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  45.21 
 
 
354 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  45.99 
 
 
348 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.27 
 
 
353 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.6 
 
 
335 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  49.12 
 
 
350 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.01 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.59 
 
 
350 aa  235  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  45.99 
 
 
339 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  39.39 
 
 
372 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.01 
 
 
339 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  42.81 
 
 
343 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 
350 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 
350 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 
350 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 
350 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 
350 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 
350 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.14 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  40.69 
 
 
326 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.6 
 
 
338 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.6 
 
 
338 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.3 
 
 
339 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  37.64 
 
 
350 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  41.72 
 
 
324 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  41.46 
 
 
324 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  38.44 
 
 
331 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  41.87 
 
 
347 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.41 
 
 
329 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  40.67 
 
 
324 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  41.88 
 
 
337 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  36.9 
 
 
344 aa  192  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  39.06 
 
 
332 aa  192  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.06 
 
 
332 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  40.37 
 
 
346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.54 
 
 
328 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  37.72 
 
 
333 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.71 
 
 
340 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  37.54 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.55 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.88 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.39 
 
 
519 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.24 
 
 
338 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  37.1 
 
 
341 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.3 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  35.84 
 
 
318 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.41 
 
 
332 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
335 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  33.63 
 
 
325 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.3 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  37.97 
 
 
320 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.25 
 
 
344 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.55 
 
 
329 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  35.56 
 
 
327 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  42.07 
 
 
344 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  36.4 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.46 
 
 
357 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.84 
 
 
366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.45 
 
 
370 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.36 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.72 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.74 
 
 
361 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.13 
 
 
360 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  23.29 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 
360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.52 
 
 
399 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.04 
 
 
375 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  23.29 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.96 
 
 
358 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  25.58 
 
 
364 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  30.1 
 
 
356 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 
351 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  29.29 
 
 
348 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  34.68 
 
 
345 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  28.94 
 
 
364 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  29.71 
 
 
364 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>