More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2819 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  100 
 
 
348 aa  679    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  54.52 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  53.37 
 
 
341 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  53.35 
 
 
336 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  53.87 
 
 
331 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  53.87 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  51.07 
 
 
334 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  52.63 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  49.54 
 
 
330 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  48.64 
 
 
348 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  49.85 
 
 
335 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  50.46 
 
 
330 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  50.88 
 
 
353 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  50.15 
 
 
339 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  57.41 
 
 
321 aa  268  7e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  50.75 
 
 
340 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  50.15 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  50.15 
 
 
334 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  52 
 
 
328 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.56 
 
 
335 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  48 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.37 
 
 
333 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  45.99 
 
 
331 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.38 
 
 
356 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  50 
 
 
343 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  50.15 
 
 
330 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  48 
 
 
341 aa  248  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  50.15 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  50.62 
 
 
339 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.81 
 
 
335 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.64 
 
 
339 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  40.22 
 
 
372 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  45.67 
 
 
330 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.94 
 
 
350 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.63 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  42.63 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  47.48 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.63 
 
 
350 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.63 
 
 
350 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.63 
 
 
350 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.63 
 
 
350 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.33 
 
 
350 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  50 
 
 
338 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  50 
 
 
338 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.33 
 
 
350 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  37.04 
 
 
350 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.63 
 
 
329 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  43.71 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  49.07 
 
 
339 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.87 
 
 
519 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  44.82 
 
 
343 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  38.23 
 
 
331 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.88 
 
 
332 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  39.88 
 
 
332 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  45.06 
 
 
329 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
318 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.79 
 
 
340 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  42.3 
 
 
333 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.73 
 
 
335 aa  182  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.46 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
331 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  42.33 
 
 
324 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  42.28 
 
 
324 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.79 
 
 
338 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.73 
 
 
328 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  42.95 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.46 
 
 
332 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  36.83 
 
 
325 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  35.17 
 
 
344 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.37 
 
 
347 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  41.52 
 
 
320 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 
346 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  41.77 
 
 
324 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  45.68 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  38.65 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.73 
 
 
344 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  36.39 
 
 
327 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  40.55 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  37.59 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.46 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 
357 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.02 
 
 
366 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.22 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  30.48 
 
 
852 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  29.72 
 
 
864 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.87 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  28.81 
 
 
863 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.52 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.17 
 
 
399 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.94 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  29.61 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  29.21 
 
 
863 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>