More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3676 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 365 aa  749    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  33.33 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.23 
 
 		 356 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.99 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  33.94 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  30.92 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  34.3 
 
 		 353 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  36.4 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.59 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  36.47 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.23 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  32.47 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.32 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  34.32 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  32.63 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  32.49 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  32.43 
 
 		 339 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  36.94 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.29 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  35.97 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  33.67 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  38.1 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  34.24 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  37.59 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.91 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.03 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.23 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.64 
 
 		 519 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.95 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  34.98 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  32.34 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  35.47 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  35.84 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.44 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  34.6 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  34.92 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.82 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  32.14 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  35.85 
 
 		 348 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  31.82 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  36.72 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  32.76 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  30.77 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  32.34 
 
 		 334 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.61 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  28.92 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  34.1 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  32.25 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  35.04 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  35.04 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.25 
 
 		 328 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  32.02 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  31.23 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  31.82 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.54 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.56 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  31.5 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  31.89 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.92 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.92 
 
 		 338 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  29.41 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.94 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  27.83 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  33.46 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  30.98 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  31.14 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.62 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  33.57 
 
 		 339 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  29.3 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.82 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.76 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.54 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  33.85 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.95 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  28.75 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.81 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.82 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.17 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  22.86 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  29.33 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  26.07 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.66 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.83 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.51 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.29 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  21.81 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  28.29 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  27.15 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  28.76 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  30.48 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  25.27 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  31.45 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>