More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1890 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  100 
 
 
331 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  75.08 
 
 
332 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  75.08 
 
 
332 aa  502  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  46.61 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  46.98 
 
 
326 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  47.4 
 
 
347 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  47.63 
 
 
329 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  46.99 
 
 
333 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  47.17 
 
 
337 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  45.23 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 
347 aa  242  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  42.99 
 
 
318 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.87 
 
 
331 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.56 
 
 
338 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.82 
 
 
329 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  40.3 
 
 
335 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  41.36 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.28 
 
 
336 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  42.38 
 
 
341 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  41.96 
 
 
353 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.29 
 
 
519 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  42.28 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  41.02 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.46 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  41.98 
 
 
324 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.37 
 
 
329 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  41.64 
 
 
336 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  40.54 
 
 
334 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  39.27 
 
 
325 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.55 
 
 
332 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  39.76 
 
 
346 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.23 
 
 
356 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  40.18 
 
 
330 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  38.44 
 
 
331 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  38.97 
 
 
348 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  41.34 
 
 
331 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  43.08 
 
 
324 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.56 
 
 
344 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  39.21 
 
 
353 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  40.98 
 
 
331 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.53 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.18 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  39.58 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  38.67 
 
 
330 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  40.96 
 
 
334 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  38.23 
 
 
348 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  39.27 
 
 
341 aa  192  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.6 
 
 
341 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.2 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  41.74 
 
 
321 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.99 
 
 
335 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
328 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  39.17 
 
 
343 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  40.48 
 
 
330 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  38.67 
 
 
330 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.89 
 
 
335 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  40.18 
 
 
330 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.34 
 
 
339 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  39.76 
 
 
350 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  39.56 
 
 
320 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.77 
 
 
329 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.55 
 
 
328 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  35.38 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.62 
 
 
350 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
350 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.66 
 
 
350 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.66 
 
 
350 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
350 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
350 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.31 
 
 
339 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  40.06 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  39.94 
 
 
344 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  33.14 
 
 
350 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  32.52 
 
 
372 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.2 
 
 
339 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
338 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
338 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
339 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  30.92 
 
 
365 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  31.44 
 
 
344 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.52 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.46 
 
 
361 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.28 
 
 
379 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.6 
 
 
362 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.74 
 
 
357 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.97 
 
 
370 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.4 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  26.04 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.53 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.5 
 
 
358 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.38 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  31.39 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.09 
 
 
375 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.99 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  29.52 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  25.97 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.53 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  26.57 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0235  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.490059 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  27.38 
 
 
364 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>