More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5780 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  100 
 
 
339 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  86.14 
 
 
339 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  85.8 
 
 
339 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  89.94 
 
 
338 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  89.94 
 
 
338 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  85.84 
 
 
339 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  90.86 
 
 
339 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  67.79 
 
 
356 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  68.09 
 
 
333 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  72.06 
 
 
350 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  67.48 
 
 
353 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  70.97 
 
 
350 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  70.97 
 
 
350 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  70.67 
 
 
350 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  70.67 
 
 
350 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  70.67 
 
 
350 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  70.67 
 
 
350 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  58.41 
 
 
335 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  59.82 
 
 
335 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  58.58 
 
 
343 aa  328  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  60.06 
 
 
350 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  56.19 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  51.94 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  54.08 
 
 
353 aa  285  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  51.2 
 
 
336 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  51.53 
 
 
341 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  48.21 
 
 
330 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  45.99 
 
 
331 aa  264  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  50.62 
 
 
348 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  45.92 
 
 
348 aa  262  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  50.3 
 
 
341 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  51.69 
 
 
331 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  47.04 
 
 
330 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  47.75 
 
 
335 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  51.08 
 
 
331 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  45.73 
 
 
334 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  46.99 
 
 
330 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  48.21 
 
 
330 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  46.25 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  45.73 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  47.62 
 
 
330 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  46.15 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  38.13 
 
 
372 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  52.01 
 
 
321 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  41.14 
 
 
326 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  41.64 
 
 
318 aa  198  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  37.31 
 
 
331 aa  195  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  43.56 
 
 
324 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  43.25 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.53 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.98 
 
 
519 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  39.51 
 
 
332 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.51 
 
 
332 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  42.6 
 
 
347 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  36.18 
 
 
350 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  42.47 
 
 
343 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.77 
 
 
336 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  37.24 
 
 
325 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  39.76 
 
 
346 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.76 
 
 
352 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  40.59 
 
 
341 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.88 
 
 
347 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  44.48 
 
 
329 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
338 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.61 
 
 
331 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  43.52 
 
 
324 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  40.19 
 
 
337 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  38.02 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  41.27 
 
 
333 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.95 
 
 
328 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  37.54 
 
 
331 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.58 
 
 
335 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  39.88 
 
 
327 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.16 
 
 
332 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  31.52 
 
 
344 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.37 
 
 
344 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  39.08 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  40.24 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  33.22 
 
 
365 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.07 
 
 
329 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.97 
 
 
357 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.47 
 
 
370 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  33.46 
 
 
361 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.72 
 
 
379 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.94 
 
 
352 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 
345 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.76 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.04 
 
 
360 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.1 
 
 
362 aa  96.3  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.86 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  30.9 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  31.23 
 
 
364 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  31.25 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  31.23 
 
 
364 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2223  hypothetical protein  39.64 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  28.27 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  30.21 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.18 
 
 
351 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.82 
 
 
352 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.73 
 
 
358 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>