More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2364 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  100 
 
 		 340 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  80.12 
 
 		 347 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  59.17 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  56.83 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  46.61 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  48.22 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  48.22 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  44.44 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  45.71 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  42.06 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  43.15 
 
 		 343 aa  210  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.15 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  42.82 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  40 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.79 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  39.59 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.49 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  41.59 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  41.3 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.65 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  39.41 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  41.4 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  40.47 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.69 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  42.9 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  40.46 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  43.48 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  39.47 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  38.71 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  41.79 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.64 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  42.14 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.29 
 
 		 519 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  38.6 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  41.59 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  36.05 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  38.12 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.22 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  39.05 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  41.59 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.18 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.57 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  39.3 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  38.82 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  36.84 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  40.72 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  39.88 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  39.24 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.71 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  36.42 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.72 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  39.22 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  39.18 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.92 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  39.41 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.72 
 
 		 329 aa  166  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  42.34 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.95 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  33.96 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  39.29 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.17 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.02 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  31.07 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.1 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.72 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  32.84 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.99 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.39 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  38.39 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  39.35 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.92 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.92 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.92 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.92 
 
 		 350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.92 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  36.83 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  37.28 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.22 
 
 		 362 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  34.97 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.23 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.22 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.51 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.51 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.16 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.64 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.41 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  31.12 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.19 
 
 		 375 aa  99.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  25.86 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  27.03 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.54 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.73 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  28.63 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  29.44 
 
 		 357 aa  93.2  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>