More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0139 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0139  aminotransferase  100 
 
 		 330 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3732  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  54.13 
 
 		 329 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1235  threonine-phosphate decarboxylase  49.39 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0882748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1754  threonine-phosphate decarboxylase  50.76 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33090  Cobalamin biosynthesis CobC protein  50.75 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1275  threonine-phosphate decarboxylase  50.15 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1457  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  52.29 
 
 		 341 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0101  aminotransferase  49.39 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47720  threonine-phosphate decarboxylase  50.61 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.053805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4114  threonine-phosphate decarboxylase  50 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4043  threonine-phosphate decarboxylase  51.36 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3677  threonine-phosphate decarboxylase  46.71 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405143  normal  0.0339835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1645  threonine-phosphate decarboxylase  47.85 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26807  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2206  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.97 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00487781  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2659  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.49 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2497  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.6 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1858  aminotransferase, class I and II  48.19 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1676  threonine-phosphate decarboxylase  51.06 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3126  histidinol phosphate aminotransferase  46.34 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3495  putative threonine-phosphate decarboxylase  45.62 
 
 		 356 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.220505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2781  putative threonine-phosphate decarboxylase  49.11 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455926  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2201  putative threonine-phosphate decarboxylase  49.1 
 
 		 335 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  0.0612495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0272  aminotransferase, class I and II  47.08 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2090  cobalamin biosynthetic protein CobC  42.54 
 
 		 372 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1712  cobalamin biosynthesis protein CobC  46.59 
 
 		 334 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0662  putative threonine-phosphate decarboxylase  44.71 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1002  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.87 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5780  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.59 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2715  threonine-phosphate decarboxylase  52.42 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0845  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.99 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2393  putative threonine-phosphate decarboxylase  49.27 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2288  threonine-phosphate decarboxylase  44.28 
 
 		 328 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2819  aminotransferase  46.36 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2365  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.01 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3743  aminotransferase, class I and II  42.99 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000372169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0841  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.59 
 
 		 350 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233168  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1838  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.69 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2449  putative threonine-phosphate decarboxylase  46.69 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2454  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.59 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.19 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.19 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.19 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  48.19 
 
 		 350 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1036  putative threonine-phosphate decarboxylase  47.89 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1130  aminotransferase, class I and II  39.18 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0792  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.56 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3136  aminotransferase  38.74 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1890  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1142  cobC protein  38.53 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1853  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  41.21 
 
 		 329 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2364  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.43 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50042  normal  0.0393732 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5025  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5730  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.52 
 
 		 519 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2122  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.65 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.312785  hitchhiker  0.00144481 
 
 
-
 
NC_004310  BR1295  cobC protein  39.4 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1258  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.4 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.461577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0789  aminotransferase  37.65 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2445  aminotransferase, class I and II  38.18 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0228466  normal  0.020665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2736  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.06 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0275238  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  38.2 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0391  aminotransferase, class I and II  39.88 
 
 		 324 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5192  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.46 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2651  aminotransferase  38.05 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.783504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5264  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  39.58 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1257  aminotransferase, class I and II  39.76 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4725  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  37.24 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0983962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  38.39 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1476  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.06 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0803755  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1655  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.36 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.586311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0369  aminotransferase  37.09 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0325  aminotransferase  35.76 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2200  aminotransferase, class I and II  38.44 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0113776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0166  threonine-phosphate decarboxylase  35.82 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4870  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  40.96 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0389  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.34 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3274  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  36.36 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2584  aminotransferase  36.06 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1155  aminotransferase, class I and II  39.17 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.276586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3676  aminotransferase class I and II  32.81 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203467  normal  0.560738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.41 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.79 
 
 		 361 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.69 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  30.56 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.96 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.38 
 
 		 370 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  30.56 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.21 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.95 
 
 		 375 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.3 
 
 		 498 aa  96.7  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.52 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  28.37 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.79 
 
 		 498 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.12 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02041  aminotransferase class-I  30 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.47 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.81 
 
 		 357 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  25.71 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>