More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3015 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3015  aminotransferase class I and II  100 
 
 
423 aa  847    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1935  aminotransferase, class I and II  40.99 
 
 
390 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1401  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  39.53 
 
 
377 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.64 
 
 
357 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  24.48 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.01 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.35 
 
 
375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  23.96 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  26.18 
 
 
364 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.51 
 
 
399 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.33 
 
 
364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  22.42 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  22.16 
 
 
358 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  30.08 
 
 
364 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  29.9 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  29.82 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.05 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.23 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  29.38 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.27 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  24.29 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  31.52 
 
 
346 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  30.33 
 
 
852 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.96 
 
 
361 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.18 
 
 
358 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.51 
 
 
362 aa  106  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  30.65 
 
 
357 aa  104  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.92 
 
 
356 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  27.14 
 
 
378 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  24.74 
 
 
340 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  28.28 
 
 
339 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  27.92 
 
 
368 aa  100  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.25 
 
 
361 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.16 
 
 
366 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  24.14 
 
 
363 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  28.57 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  28.57 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.98 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  27.54 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  28.4 
 
 
383 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.37 
 
 
352 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.94 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  21.07 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.3 
 
 
368 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  26.63 
 
 
864 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  27.35 
 
 
355 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  22.59 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  21.61 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.94 
 
 
362 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  23.97 
 
 
370 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  25.24 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  26.26 
 
 
368 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  24.04 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  21.35 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  21.73 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  24.8 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  24.04 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  29.27 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.16 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  23.67 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  25.96 
 
 
863 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  30.17 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  26.09 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  20.78 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  23.43 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  26.21 
 
 
863 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.94 
 
 
848 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.9 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  29.33 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  24.74 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  25.8 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  24.66 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  26.11 
 
 
858 aa  81.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  24.29 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  26.23 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  28.28 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  27.76 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  23.33 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  27.33 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  24.03 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  24.2 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  24.03 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  24.03 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  24.03 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  24.81 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.92 
 
 
498 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  22.34 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  20 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  22.9 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  22.67 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  22.22 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  26.18 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  25.8 
 
 
362 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  26.43 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.47 
 
 
366 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  20.51 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  21.48 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.65 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>