More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1371 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1371  putative aminotransferase  100 
 
 
344 aa  696    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0860  putative aminotransferase  45.02 
 
 
323 aa  269  4e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  27.95 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.34 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  28.57 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.76 
 
 
368 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  27.51 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  26.01 
 
 
371 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  25.9 
 
 
364 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  25.66 
 
 
368 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  27.51 
 
 
354 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.95 
 
 
368 aa  107  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.95 
 
 
368 aa  107  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.95 
 
 
366 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25 
 
 
375 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  24.57 
 
 
360 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.08 
 
 
360 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.31 
 
 
498 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  24.72 
 
 
864 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  22.49 
 
 
357 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.53 
 
 
352 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  25.52 
 
 
373 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.15 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  24.12 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.27 
 
 
352 aa  97.4  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2182  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.75 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.243931  hitchhiker  0.000290112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 
357 aa  95.9  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  21.83 
 
 
357 aa  95.9  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.84 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  24.63 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  26.61 
 
 
346 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.65 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  25.46 
 
 
355 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  26.36 
 
 
363 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  24.4 
 
 
364 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  24.45 
 
 
355 aa  92.8  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  24.11 
 
 
364 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  23.14 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  24.7 
 
 
364 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  24.45 
 
 
356 aa  92.8  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 
363 aa  92  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.14 
 
 
498 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  26.25 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  25 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.16 
 
 
496 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  24.7 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 
807 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  25.45 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  27.85 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  24.71 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  26.09 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  25.94 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.71 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  24.07 
 
 
367 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  24.62 
 
 
387 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  25.65 
 
 
386 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.49 
 
 
379 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0235  aminotransferase class I and II  25 
 
 
353 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.490059 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  26.75 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  22.19 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  24.92 
 
 
331 aa  87.8  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  22.71 
 
 
364 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2375  histidinol-phosphate aminotransferase  26.75 
 
 
356 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.18 
 
 
332 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  20.9 
 
 
863 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  25.98 
 
 
363 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  23.45 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  24.5 
 
 
388 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0991  aminotransferase class I and II  22.83 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.66 
 
 
356 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  21.41 
 
 
863 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.2 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3684  histidinol phosphate aminotransferase  24.77 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  22.29 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  22.35 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  22.74 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1426  aminotransferase class I and II  26.61 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  22.92 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  22.32 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.28 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  21.08 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  22.16 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  23.58 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  24.8 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  27.92 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.64 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  22.57 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  22.57 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  23.72 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  25.29 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  22.57 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  22.79 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  21.64 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  21.1 
 
 
362 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.14 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  26.67 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  23.58 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  22.57 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>