More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0235 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0235  aminotransferase class I and II  100 
 
 
353 aa  687    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.490059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  62.57 
 
 
336 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  59.15 
 
 
352 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  59.54 
 
 
365 aa  361  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0991  aminotransferase class I and II  50.27 
 
 
383 aa  322  4e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.72 
 
 
496 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 
498 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.75 
 
 
358 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  28.82 
 
 
356 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  32.17 
 
 
498 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.18 
 
 
361 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.33 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  36.67 
 
 
361 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.62 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  34.23 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.24 
 
 
366 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  35.12 
 
 
357 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.63 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.31 
 
 
399 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  30.38 
 
 
363 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.3 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  27.65 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  28.31 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  35.44 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  28.07 
 
 
362 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  29.61 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.18 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  29.18 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.54 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  28.86 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.56 
 
 
379 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  30.24 
 
 
364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  30.54 
 
 
364 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  30.24 
 
 
364 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 
348 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.94 
 
 
335 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.61 
 
 
362 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.53 
 
 
356 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  31.16 
 
 
355 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.12 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.63 
 
 
370 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  29.91 
 
 
363 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  30.51 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  31.18 
 
 
357 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  30.32 
 
 
399 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  31.72 
 
 
852 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.81 
 
 
361 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  23.1 
 
 
358 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  25.5 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  23.1 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  27.06 
 
 
357 aa  116  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.36 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 
352 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 
352 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.16 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  33.53 
 
 
350 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  32.75 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  31.49 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.17 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0872  histidinol-phosphate aminotransferase  27.05 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  26.67 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  30.33 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.99 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  30.61 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  30.12 
 
 
863 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  24.77 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.52 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  25.73 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.14 
 
 
348 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  30.88 
 
 
352 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  28.1 
 
 
331 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  26.56 
 
 
351 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  30.96 
 
 
362 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  25.7 
 
 
354 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  25.96 
 
 
371 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  23.24 
 
 
359 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  23.53 
 
 
371 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  30.75 
 
 
863 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 
375 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  30.32 
 
 
369 aa  106  6e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.95 
 
 
359 aa  106  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.73 
 
 
372 aa  105  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  27.1 
 
 
374 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  31.64 
 
 
365 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  29.81 
 
 
364 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  26 
 
 
364 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  29.39 
 
 
369 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  23.68 
 
 
371 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1371  putative aminotransferase  25.29 
 
 
344 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2622  cobalamin biosynthetic protein  35.04 
 
 
337 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0228702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  26.83 
 
 
364 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  27.7 
 
 
366 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
350 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1744  aminotransferase class I and II  36.32 
 
 
333 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  33.33 
 
 
353 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  33.33 
 
 
353 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  26.3 
 
 
373 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  33.33 
 
 
353 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.483357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>